没有房产证的房子签订的协议并不一定无效，其效力需根据具体情况及法律规定来判断。以下是从不同角度对这一问题的详细分析：
一、协议有效的情况
合法建造的房屋：
- 对于合法建造的房屋，即使暂时未取得房产证（如新建商品房在交房时业主尚未拿到房产证），只要买卖双方就房屋买卖达成真实意思表示，且不违反法律法规的强制性规定，不违背公序良俗，该协议即为有效。根据《中华人民共和国民法典》第二百一十五条，当事人之间订立有关设立、变更、转让和消灭不动产物权的合同，除法律另有规定或者当事人另有约定外，自合同成立时生效；未办理物权登记的，不影响合同效力。
- 举例：张先生购买了一套新建商品房，交房时房产证尚未办理下来。张先生与开发商签订了购房协议，并支付了房款。虽然此时房产证未办理，但该购房协议是有效的，因为房屋是合法建造的，且双方意思表示真实。
农村房屋买卖：
- 在农村房屋买卖中，若交易发生在同一集体经济组织成员之间，且符合农村宅基地的相关政策和法律法规，即使房屋没有房产证，协议通常也认定为有效。
- 举例：李先生和王先生是同一村集体的成员，李先生有一套农村房屋想要出售给王先生。虽然该房屋没有房产证，但双方签订了买卖协议，并符合农村宅基地的相关政策，因此该协议是有效的。
二、协议无效的情况
房屋属于违法建筑：
- 若房屋是未经规划许可或未按照规划许可建设的违法建筑，基于该房屋签订的协议通常是无效的。因为这违反了土地管理和城乡规划等相关法律法规。根据《中华人民共和国民法典》第一百五十三条，违反法律、行政法规的强制性规定的民事法律行为无效。
- 举例：赵先生购买了一套未经规划许可建设的房屋，双方签订了买卖协议。但由于该房屋是违法建筑，因此该协议是无效的。
存在欺诈、胁迫等法定无效事由：
- 如果在签订协议时，一方使用欺诈、胁迫手段使对方在违背真实意思的情况下签订协议，该协议同样无效。例如，卖方故意隐瞒房屋没有合法产权的事实，欺骗买方签订购买协议，买方在得知真相后可以主张协议无效。
- 举例：钱先生想要购买一套房屋，卖方故意隐瞒房屋没有房产证的事实，欺骗钱先生签订了买卖协议。后来钱先生发现真相后，可以主张该协议无效。
三、协议效力与物权变动的区分
- 协议效力：根据《民法典》的相关规定，协议的效力与物权的变动是两个独立的概念。即使房屋没有房产证，只要协议满足法律规定的条件（如双方具备民事行为能力、意思表示真实且不违法），该协议仍然有效。
- 物权变动：根据《中华人民共和国民法典》第二百零九条，不动产物权的设立、变更、转让和消灭，经依法登记，发生效力；未经登记，不发生效力，但是法律另有规定的除外。因此，没有房产证的房屋，其物权变动可能无法完成，但这并不影响买卖协议的效力。
四、协议的风险与保障措施
- 风险：虽然协议可能有效，但由于房屋没有房产证，可能存在所有权不明确、无法办理贷款等手续的风险，这些可能影响协议的履行并导致纠纷。
- 保障措施：为了降低风险，买卖双方在签订协议时应制定严密的协议条款，明确双方的权利和义务，特别是关于产权证的约定。同时，建议在签订前详细调查房屋的产权状况，确保卖方具有完全的处分权，并了解房屋是否存在任何法律纠纷或限制。
总结与建议：没有房产证的房子签订的协议并不必然无效，其效力需根据具体情况及法律规定综合判断。在签订此类协议时，应充分了解相关法律法规和风险，并采取必要的保障措施以维护自身权益。如果您在房产交易过程中遇到任何法律问题或需要进一步的法律建议，请随时向我咨询。