公司指定员工个人收款是否合法，需分情况讨论：
若公司有合法理由且程序合规：
- 在某些特定情况下，如公司账户暂时无法使用、需要紧急处理某笔交易等，公司可能会临时指定员工个人账户进行收款。但这种情况下，公司必须确保有充分的合法理由，并且程序上应当合规，比如应当有明确的内部审批流程，确保该行为是出于公司利益且经过合法授权。
- 法律背景：根据《中华人民共和国公司法》及相关财务规定，公司应当使用其自有账户进行资金往来，以确保资金的安全和合规性。但在特殊情况下，如果公司能够证明指定员工个人收款是出于必要且合法的目的，并且已经采取了必要的风险控制措施，这种行为可能不会被视为违法。
若公司无合法理由或程序不合规：
- 如果公司没有合法理由，或者未经合法授权、未遵循内部审批流程就指定员工个人收款，这种行为可能构成违法。它可能涉及逃避税务监管、资金挪用、洗钱等违法行为，不仅会对公司造成法律风险，也会对员工个人带来严重的法律后果。
- 法律后果：对于公司而言，可能面临税务处罚、行政处罚甚至刑事责任；对于员工个人而言，如果被认定为协助公司进行违法行为，也可能面临法律责任，包括但不限于罚款、没收违法所得、甚至刑事责任。
员工个人应如何应对：
- 如果员工被公司指定个人收款，应当首先询问公司是否有合法理由和内部审批流程，并要求公司提供相关证明文件。
- 如果员工对公司的行为存在疑虑或担忧，应当及时向公司高层或法务部门反映，并寻求专业法律意见。
- 重要建议：员工个人应当明确拒绝参与任何可能涉及违法的行为，保护自己的合法权益和声誉。
额外提醒：
- 对于公司而言，应当建立健全的财务管理制度，确保所有资金往来都通过公司自有账户进行，避免使用员工个人账户进行收款或付款。
- 如果公司确实需要临时使用员工个人账户进行收款，应当确保有充分的合法理由和内部审批流程，并及时向税务等相关部门报备。
总结：公司指定员工个人收款是否合法，取决于公司是否有合法理由且程序是否合规。员工在面对这种情况时，应当保持警惕并寻求专业法律意见，以保护自己的合法权益。如果你有任何具体的法律问题或需要进一步的法律建议，可以直接向我咨询。