结论前置：在镇政府判的宅基地边界复议期过了，且区政府不予受理后，您仍然可以向法院起诉。以下是详细解释和建议：

一、法律背景与依据

1. 行政复议与行政诉讼的关系：

   • 行政复议是行政相对人认为行政行为侵犯其合法权益时，向上一级行政机关或法律、法规规定的行政机关提出申请，由受理申请的行政机关对原行政行为进行审查并作出决定的活动。
   • 行政诉讼则是行政相对人认为行政行为侵犯其合法权益，向人民法院提起诉讼，由人民法院对行政行为进行审查并作出裁判的活动。
   • 行政复议并非行政诉讼的前置程序，即您可以选择先申请行政复议，对复议结果不服再提起行政诉讼；也可以直接选择提起行政诉讼。

2. 复议期过后与不予受理的情况：

   • 如果您未在规定的复议期限内申请行政复议，或者复议机关（如区政府）决定不予受理您的复议申请，这并不影响您向法院提起行政诉讼的权利。

二、向法院起诉的具体操作

1. 起诉条件：

   • 您需要是认为镇政府判的宅基地边界行为侵犯其合法权益的公民、法人或其他组织。
   • 有明确的被告（即镇政府）。
   • 有具体的诉讼请求和事实根据。
   • 属于人民法院受案范围和受诉人民法院管辖。

2. 起诉流程：

   • 准备起诉材料：包括起诉状、证据材料（如宅基地证、相关行政行为文书、复议申请及不予受理决定等）、身份证明等。
   • 提交起诉材料：将起诉材料提交至有管辖权的人民法院（通常是镇政府所在地的基层人民法院）。
   • 缴纳诉讼费：按照法院的要求缴纳诉讼费用。
   • 等待法院受理与审理：法院会对您的起诉进行审查，符合起诉条件的会予以受理，并安排开庭审理。

三、可能面临的法律后果与建议

1. 法律后果：

   • 如果法院认为镇政府的行政行为合法，会判决驳回您的诉讼请求。
   • 如果法院认为镇政府的行政行为违法，会判决撤销或变更该行政行为，并可能要求镇政府承担相应的法律责任（如赔偿损失等）。

2. 建议：

   • 及时起诉：虽然复议期已过，但您仍应尽快向法院起诉，以免超过诉讼时效。
   • 充分准备证据：收集并整理好与宅基地边界相关的所有证据材料，以支持您的诉讼请求。
   • 寻求专业帮助：如果您对法律程序或证据收集等方面存在疑问，可以寻求专业律师的帮助，以确保您的权益得到充分保障。

最后，向法院起诉是维护您合法权益的一种有效途径。在起诉过程中，请务必遵循法律程序，充分准备证据，并寻求专业帮助以确保您的权益得到最大程度的保障。如果您有任何法律问题或需要进一步的法律咨询，请直接向我提问。