在行政复议中，申请人查阅被申请人提交的书面材料后，确实有权发表意见。以下是对这一问题的详细解释：
法律依据与权利基础
根据《中华人民共和国行政复议法》及相关实施条例的规定，行政复议过程应当遵循公正、公开、及时、便民的原则。其中，公开原则要求行政复议机关在办理行政复议案件时，应当保障当事人的知情权，允许当事人查阅、复制与案件有关的材料，并发表自己的意见。这一规定为申请人在查阅被申请人提交的书面材料后发表意见提供了明确的法律依据。
发表意见的具体情形与方式
查阅材料后的即时反馈：
- 申请人在查阅被申请人提交的书面材料后，如果发现材料中有不实之处、遗漏关键信息或存在其他问题，可以立即向行政复议机关提出书面或口头意见。
- 这些意见应当围绕材料的真实性、合法性、关联性等方面展开，旨在帮助行政复议机关更全面地了解案件事实，作出公正的裁决。
在行政复议过程中的正式陈述：
- 除了即时反馈外，申请人还可以在行政复议过程中，通过提交书面陈述、参加听证会等方式，进一步阐述自己的观点和理由。
- 这些陈述和意见应当具体、明确，并附有相关证据或法律依据，以增强其说服力和可信度。
发表意见的意义与影响
保障申请人的合法权益：
- 允许申请人发表意见，是保障其合法权益的重要体现。通过发表意见，申请人可以充分表达自己的诉求和理由，争取行政复议机关的支持和认可。
促进行政复议的公正性：
- 申请人的意见是行政复议机关了解案件事实、作出公正裁决的重要参考。通过听取申请人的意见，行政复议机关可以更全面地掌握案件情况，避免片面性和主观性，从而提高裁决的公正性和准确性。
增强行政复议的透明度：
- 允许申请人发表意见，还有助于增强行政复议的透明度。通过公开、透明的程序，让申请人参与到行政复议过程中来，可以增强其对行政复议结果的信任和接受度，从而减少社会矛盾和纠纷。
注意事项与建议
及时行使权利：
- 申请人在查阅被申请人提交的书面材料后，应当及时行使发表意见的权利。如果错过时机，可能会影响行政复议机关对案件的处理和裁决。
准备充分、有理有据：
- 申请人在发表意见时，应当准备充分、有理有据。通过收集相关证据、查阅法律法规等方式，为自己的观点和理由提供有力支持。
遵守程序规定：
- 申请人在发表意见时，应当遵守行政复议机关的程序规定。按照要求提交书面陈述、参加听证会等，确保自己的意见能够得到及时、有效的传达和处理。
如果您在行政复议过程中遇到任何问题或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。我会根据您的具体情况，提供专业、全面的法律建议和支持。