开发商扣房产证一般是不合法的。以下从不同角度为你详细分析：

法律角度

根据《城市房地产开发经营管理条例》以及《商品房销售管理办法》等相关规定，房地产开发企业应当在商品房交付使用之日起一定期限内（通常是60日内），将需要由其提供的办理房屋权属登记的资料报送房屋所在地房地产行政主管部门，并协助购房人办理房屋所有权登记手续，领取房产证。这意味着，开发商有义务协助购房人办理房产证，而不是扣留房产证。如果开发商扣留房产证，可能构成违约行为，购房人有权要求开发商交付房产证，并可能要求开发商承担违约责任。

实际操作角度

在实际操作中，开发商扣留房产证可能有多种原因，比如购房人未付清房款、未缴纳相关税费或物业费等。然而，这些原因并不能成为开发商扣留房产证的合法依据。如果购房人确实存在未付清房款或未缴纳相关费用的情况，开发商应该通过合法途径来追讨，比如向法院提起诉讼或申请仲裁，而不是扣留房产证。

购房人应对策略

1. 与开发商协商：如果购房人发现开发商扣留了房产证，首先可以尝试与开发商进行协商，了解扣留的原因，并要求开发商交付房产证。
2. 寻求法律援助：如果协商无果，购房人可以向当地房地产行政主管部门投诉，或者向法院提起诉讼，要求开发商交付房产证并承担违约责任。
3. 保留证据：在整个过程中，购房人应该保留好相关证据，比如购房合同、付款凭证、与开发商的沟通记录等，以便在需要时提供证明。

特殊情况说明

虽然一般情况下开发商扣留房产证是不合法的，但也存在一些特殊情况。比如，如果购房人与开发商在购房合同中明确约定了开发商可以扣留房产证的条件和期限，并且这种约定不违反法律法规的强制性规定，那么开发商在符合约定条件的情况下扣留房产证可能是合法的。然而，这种情况相对较少见，且购房人在签订购房合同时应该仔细阅读合同条款，避免陷入不利境地。

综上所述，开发商扣房产证一般是不合法的。如果你遇到了这种情况，建议先与开发商协商解决；如果协商无果，可以向当地房地产行政主管部门投诉或向法院提起诉讼。如果你还有其他关于房产方面的问题，可以直接向我咨询。