开发商扣押购房发票是不合法的行为。以下从多个角度为你详细分析：

从法律规定角度

根据《中华人民共和国发票管理办法》等相关法律法规，销售商品、提供服务以及从事其他经营活动的单位和个人，对外发生经营业务收取款项，收款方应当向付款方开具发票。在房屋买卖交易中，开发商作为收款方，在购房者支付购房款后，有义务及时向购房者开具购房发票。扣押购房发票违反了发票管理的相关规定，损害了购房者的合法权益。

从购房者权益角度

1. 办理产权证需要：购房发票是办理房屋产权证的重要凭证之一。没有购房发票，购房者在办理产权证时可能会遇到阻碍，导致无法顺利取得房屋产权证书，影响对房屋的合法所有权。
2. 提取公积金需要：如果购房者计划提取住房公积金用于偿还房贷或支付购房款，购房发票也是必不可少的证明材料。没有发票，可能无法正常提取公积金，给购房者带来经济上的不便。
3. 房屋交易和再出售需要：在未来房屋进行交易或再出售时，购房发票可以作为房屋原始价值的证明，对于计算房屋交易税费等具有重要意义。没有发票，可能会在交易过程中产生额外的税费或纠纷。

从法律后果角度

如果开发商扣押购房发票，购房者可以采取以下措施维护自己的合法权益：

1. 与开发商协商：首先，购房者可以尝试与开发商进行友好协商，要求其尽快开具并交付购房发票。在协商过程中，要注意保留好相关的沟通记录，如书面函件、聊天记录等，以备后续可能的需要。
2. 向税务部门投诉：如果协商无果，购房者可以向当地税务部门投诉开发商的违法行为。税务部门有权对开发商进行调查和处理，要求其开具发票并承担相应的法律责任。
3. 通过法律途径解决：购房者还可以向人民法院提起诉讼，要求开发商开具购房发票并赔偿因扣押发票给自己造成的损失。在诉讼过程中，购房者需要提供相关的证据，如购房合同、付款凭证等，以证明自己的主张。

综上所述，开发商扣押购房发票是不合法的行为，购房者有权要求开发商开具并交付发票，以维护自己的合法权益。如果你在房屋买卖过程中遇到类似问题，或者有其他法律方面的疑问，都可以直接向我咨询。