犯罪事实无法查清时，案件并不一定会直接撤案，这取决于案件所处的阶段以及具体的情况。以下从不同角度为你详细分析：

侦查阶段

在刑事案件的侦查阶段，如果经过公安机关的深入调查，仍然无法查清犯罪事实，或者证据不足以支持犯罪嫌疑人的犯罪行为，那么根据《中华人民共和国刑事诉讼法》的相关规定，公安机关可以作出撤销案件的决定。这一决定通常是在经过充分调查，确认没有犯罪事实或者犯罪事实显著轻微，不需要追究刑事责任的情况下作出的。

举例说明：假设某人被指控盗窃，但经过公安机关的调查，发现现场没有留下任何指纹、DNA等直接证据，且没有目击者能够指认犯罪嫌疑人，同时犯罪嫌疑人也坚称自己没有实施盗窃行为。在这种情况下，如果公安机关认为无法进一步查清犯罪事实，可能会考虑撤销案件。

审查起诉阶段

如果案件已经进入审查起诉阶段，即公安机关已经将案件移送至人民检察院进行审查起诉，此时如果人民检察院认为犯罪事实不清、证据不足，不符合起诉条件，那么根据《中华人民共和国刑事诉讼法》的规定，人民检察院可以作出不起诉的决定。这并不意味着案件被“撤案”，但结果上是案件不会进入审判阶段，犯罪嫌疑人不会被提起公诉。

举例说明：在上述盗窃案例中，如果公安机关已经将案件移送至人民检察院，但人民检察院在审查过程中发现证据不足，无法证明犯罪嫌疑人有罪，那么人民检察院可能会作出不起诉的决定。

审判阶段

在审判阶段，如果法院经过审理认为犯罪事实不清、证据不足，不能认定被告人有罪，那么根据《中华人民共和国刑事诉讼法》的规定，法院应当作出无罪判决。这同样不意味着案件被“撤案”，而是法院以法律的形式确认了被告人的无罪状态。

特殊情况说明：

1. 补充侦查：在审查起诉阶段，如果人民检察院认为案件需要补充侦查，可以退回公安机关补充侦查，也可以自行侦查。补充侦查以二次为限。如果经过二次补充侦查，人民检察院仍然认为证据不足，不符合起诉条件的，应当作出不起诉的决定。

2. 存疑不起诉：在司法实践中，如果案件存在重大疑点，且经过补充侦查后仍然无法查清犯罪事实，人民检察院可能会作出存疑不起诉的决定。这种决定是基于对案件证据的充分评估后作出的，体现了对犯罪嫌疑人合法权益的保护。

建议与提醒：

• 如果你或你身边的人正面临类似情况，建议及时咨询专业律师，以便更准确地了解案件进展和可能的法律后果。
• 在刑事案件中，证据的收集和保存至关重要。如果认为自己的权益受到侵害，应尽快收集并保存相关证据，以便在后续的法律程序中维护自己的合法权益。

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