公司以劳动合同约定的条款为由辞退员工是否合法，需根据具体情况综合分析。以下是从不同角度的详细分析：
一、合法辞退的情形
劳动合同中有明确且合法的辞退条款：
- 如果劳动合同中明确约定了某些特定情况下公司可以辞退员工，且这些条款不违反法律法规的强制性规定（如不违反《中华人民共和国劳动合同法》中关于辞退的禁止性规定），同时公司能够证明员工确实存在这些特定情况（如严重违反公司规章制度、严重失职等），那么公司依据这些条款辞退员工是合法的。
- 例子：劳动合同中约定，员工若连续旷工超过15天，公司有权解除劳动合同。若员工确实连续旷工超过15天，公司依据此条款辞退员工，则是合法的。
员工存在法定可辞退情形：
- 即使劳动合同中没有明确约定，但如果员工存在《中华人民共和国劳动合同法》第三十九条规定的情形（如试用期不符合录用条件、严重违反规章制度、被依法追究刑事责任等），公司也有权辞退员工，且无需支付经济补偿。
二、不合法辞退的情形
劳动合同条款违法或显失公平：
- 如果劳动合同中的辞退条款违反了法律法规的强制性规定，或者显失公平（如约定公司可以无理由随时辞退员工），那么这些条款是无效的。公司依据这些无效条款辞退员工，则构成违法辞退。
公司未履行法定程序或未提供充分证据：
- 即使员工存在可辞退的情形，但如果公司未按照法律规定的程序进行辞退（如未提前通知工会、未向员工说明辞退理由等），或者未能提供充分证据证明员工存在可辞退的情形，那么公司的辞退行为也可能被认定为违法。
- 例子：公司以员工“不能胜任工作”为由辞退员工，但未能提供员工不能胜任工作的具体证据，也未按照法律规定对员工进行培训或调整工作岗位，那么这种辞退就是违法的。
特殊保护期间辞退：
- 在员工处于孕期、产期、哺乳期，或因工负伤、患病等特定情形下，即使劳动合同中有相关辞退条款，公司也不能直接辞退员工。若公司违反此规定，同样构成违法辞退。
三、法律后果
若公司以劳动合同约定的条款为由辞退员工的行为不合法，员工有权要求公司继续履行劳动合同；若劳动合同已无法继续履行或员工不要求继续履行，公司应按照经济补偿标准的二倍向员工支付赔偿金。经济补偿的计算方式为：按员工在本单位工作的年限，每满一年支付一个月工资的标准向劳动者支付。六个月以上不满一年的，按一年计算；不满六个月的，向劳动者支付半个月工资的经济补偿。
建议：
- 对于公司：在辞退员工时，务必确保辞退行为符合法律法规的规定和劳动合同的约定。首先，应仔细审查劳动合同中的辞退条款；其次，需对照《中华人民共和国劳动合同法》等相关法律法规，判断辞退行为的合法性；最后，根据具体情况决定是否支付经济补偿或赔偿金，并履行好法定程序。
- 对于员工：若遭遇公司以劳动合同约定条款为由辞退的情况，应首先审查劳动合同中的相关条款是否合法有效；其次，收集证据证明公司辞退行为是否合法；最后，若认为公司辞退行为违法，可及时通过法律途径维护自己的合法权益。
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