医疗机构未经批准擅自开设新科室，将面临以下法律责任：

1. 行政处罚：

   • 根据《医疗机构管理条例》及相关规定，医疗机构必须按照其登记的诊疗科目开展诊疗活动。若未经批准擅自开设新科室，卫生行政部门将责令其立即改正，并可能给予警告、罚款等行政处罚。具体罚款数额会根据违规情节的严重程度、是否造成危害后果等因素综合确定。
   • 若医疗机构拒不改正或情节严重，卫生行政部门还有权吊销其《医疗机构执业许可证》，这是对医疗机构最严厉的行政处罚之一，意味着该机构将失去合法执业的资格。

2. 民事责任：

   • 如果医疗机构因擅自开设新科室而导致患者受到损害，如误诊、误治等，医疗机构还需承担相应的民事赔偿责任。这包括赔偿患者的医疗费、误工费、护理费、残疾赔偿金、死亡赔偿金等直接和间接损失。
   • 在民事赔偿方面，患者有权要求医疗机构提供充分的证据证明其诊疗行为与损害结果之间不存在因果关系，否则医疗机构应承担举证不能的不利后果。

3. 刑事责任（在极端情况下）：

   • 虽然医疗机构未经批准擅自开设新科室本身不直接构成犯罪，但如果因此导致严重后果，如患者死亡或严重残疾，且医疗机构或相关责任人员存在故意或重大过失，那么相关责任人员可能构成医疗事故罪或其他相关犯罪，面临刑事追究。
   • 刑事责任的承担将取决于具体案件的事实、证据以及相关法律法规的规定。

法律建议：

• 医疗机构应严格遵守相关法律法规，确保所有诊疗活动均在登记的诊疗科目范围内进行。如需开设新科室或增加诊疗科目，应提前向卫生行政部门申请并获得批准。
• 医疗机构应加强内部管理，建立健全的诊疗科目管理制度和质量控制体系，确保诊疗活动的安全性和有效性。
• 如遇患者因擅自开设新科室而受到损害的情况，医疗机构应积极与患者沟通协商，妥善处理纠纷，避免矛盾升级。同时，医疗机构也应主动配合卫生行政部门的调查和处理工作。

可能后果：

• 医疗机构若未经批准擅自开设新科室，不仅可能面临行政处罚和民事赔偿，还可能损害其声誉和信誉，影响患者的信任度和就诊意愿。
• 在极端情况下，相关责任人员还可能面临刑事追究，这将对其个人职业生涯和家庭生活产生严重影响。

因此，医疗机构应严格遵守相关法律法规，确保合法合规经营，以维护患者权益和自身声誉。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。