擅自改变医疗机构审批设置，根据相关法律法规，将会受到相应的处罚。具体来说：
行政处罚：根据《医疗机构管理条例》及相关规定，医疗机构擅自改变设置标准、服务范围或诊疗科目的，由县级以上人民政府卫生行政部门责令改正，并可根据情节轻重处以警告、罚款、吊销《医疗机构执业许可证》等行政处罚。罚款的具体数额会依据违法行为的严重程度和当地的相关规定来确定。
法律责任：如果擅自改变医疗机构审批设置的行为导致了医疗事故的发生，或者造成了患者的人身损害，医疗机构及其相关责任人员还可能面临民事赔偿、甚至刑事责任的追究。在民事赔偿方面，医疗机构需要承担因其违法行为给患者造成的经济损失和人身伤害赔偿责任；在刑事责任方面，如果构成犯罪，将依法追究刑事责任。
因此，建议医疗机构在运营过程中严格遵守相关法律法规和审批设置要求，避免擅自改变设置标准、服务范围或诊疗科目，以免引发不必要的法律风险和责任。如果有任何疑问或需要进一步的法律咨询，请直接向我提问。