结论前置：公司在员工休三天带薪丧假期间扣除全勤奖的做法，通常是不合理且可能不合法的。员工有权要求公司恢复其应得的全勤奖，并在必要时通过法律途径维护自己的合法权益。

详细分析：

1. 丧假的法律性质与待遇：

   • 丧假是法律赋予员工在其直系亲属（如父母、配偶、子女等）死亡时享有的合法假期。
   • 根据《中华人民共和国劳动法》第五十一条的规定，劳动者在婚丧假期间，用人单位应当依法支付工资。此外，劳动部《工资支付暂行规定》第十一条也明确指出，劳动者依法享受丧假期间，用人单位应按劳动合同规定的标准支付劳动者工资。
   • 这意味着，丧假是一种带薪假期，员工在此期间享受与正常工作期间相同的工资和福利待遇，包括全勤奖（如果全勤奖的发放不依赖于出勤天数以外的其他条件）。

2. 全勤奖的定义与发放原则：

   • 全勤奖是公司为了鼓励员工保持全勤工作而设立的一种额外奖励制度，它并非薪水的一部分，而是作为一种福利或激励措施存在。
   • 全勤奖的发放通常基于员工在特定周期内（如一个月）是否出现了迟到、早退、请假等情况。然而，对于依法享有的带薪假期，如丧假，不应计入影响全勤奖发放的缺勤范畴。

3. 丧假与全勤奖的关系：

   • 丧假是基于法定事由的合理休假，员工在此期间享有特殊的法律保护。因此，将丧假认定为影响全勤奖的缺勤情况是不合理的，也是违背丧假制度立法本意的。
   • 员工在休丧假期间，其获得全勤奖的正当权益不应被侵犯。公司应当尊重员工的法定权利，不得因员工休丧假而扣减其全勤奖金。

4. 公司规章制度与合法性审查：

   • 如果公司规章制度中明确规定休丧假会影响全勤奖的发放，那么这一规定可能因违反法律法规的强制性规定而无效。
   • 员工在面临此类问题时，应首先查阅公司的规章制度或劳动合同，了解关于丧假和全勤奖的具体规定。如认为公司规定不合理或不明确，可与人事部门沟通协商，尝试争取自身权益。

5. 维权途径与建议：

   • 友好沟通：首先，建议员工与公司的人力资源部门或上级领导进行友好沟通，明确说明丧假的法律性质以及不应因休丧假而扣全勤奖的依据，要求公司纠正错误做法。
   • 法律途径：若沟通无果，员工可以向当地的劳动监察部门投诉，请求他们介入调查并督促公司改正；也可以考虑申请劳动仲裁或提起诉讼，通过法律途径维护自己的合法权益。
   • 证据保留：在采取行动前，员工应注意保留好与丧假相关的证明材料，如亲属的死亡证明、请假申请记录等，以便在必要时作为维权的有力证据。

总结与建议：

公司在员工休带薪丧假期间扣除全勤奖的做法是不符合法律规定的。员工应当了解自己的合法权益，并在必要时采取适当的措施来维护自己的权益。如果遇到类似问题，建议首先与公司进行友好沟通，如果无法解决，再考虑通过法律途径来维护自己的合法权益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。