结论：未经许可擅自在河道内打井，主要违反了《中华人民共和国水法》第四十八条和第六十九条的相关规定。

详细分析：

1. 法律依据：

   • 《中华人民共和国水法》第四十八条：该条款明确规定，直接从江河、湖泊或者地下取用水资源的单位和个人，应当按照国家取水许可制度和水资源有偿使用制度的规定，向水行政主管部门或者流域管理机构申请领取取水许可证，并缴纳水资源费，取得取水权。河道内的水资源属于该条款所涵盖的范畴，因此，未经许可擅自在河道内打井取水，显然违反了这一规定。
   • 《中华人民共和国水法》第六十九条：该条款进一步规定了未经批准擅自取水的法律后果，即由县级以上人民政府水行政主管部门或者流域管理机构依据职权，责令停止违法行为，限期采取补救措施，并处二万元以上十万元以下的罚款；情节严重的，还可能吊销其取水许可证。

2. 法律后果：

   • 如果未经许可擅自在河道内打井，水行政主管部门将有权责令停止违法行为，并要求限期采取补救措施，如回填井等。
   • 同时，还将面临二万元以上十万元以下的罚款处罚。如果情节严重，如多次违法、造成水资源严重浪费或破坏等，还可能被吊销取水许可证（若已取得）。

3. 特殊情况说明：

   • 需要注意的是，家庭生活和零星散养、圈养畜禽饮用等少量取水的除外，这些情况通常不需要申请取水许可证。但河道内打井往往涉及较大量的水资源取用，因此不太可能属于这一例外情况。

建议与提醒：

• 在进行任何涉及水资源取用的活动前，务必了解并遵守相关法律法规和政策要求，按照规定办理相关审批手续。
• 合理利用地下水资源，保护水资源和环境，避免造成不必要的损害和浪费。
• 如果对相关法律法规或审批流程有疑问，可以直接向我咨询，我将为你提供专业的法律意见和帮助。