证券公司收取千分之三的佣金，在符合相关规定的情况下是合法的。以下从不同角度为你详细分析：
佣金收取的合法性基础
根据《证券法》及相关规定，证券公司为客户提供证券交易服务时，可以收取佣金。佣金是证券公司为客户提供代理买卖证券服务所收取的报酬，其收取标准应当遵循公平、合理、公开的原则，并不得违反法律、行政法规和国务院证券监督管理机构的规定。
佣金收取的具体规定
佣金比例：虽然法律没有明确规定具体的佣金比例上限，但通常证券公司会根据市场情况、客户类型、交易量等因素来制定佣金比例。千分之三的佣金比例在某些情况下是合理的，尤其是对于交易量较小或交易不频繁的客户。然而，对于交易量较大或交易频繁的客户，证券公司可能会提供更低的佣金比例以吸引客户。
佣金透明度：证券公司应当在与客户签订证券交易委托协议时，明确告知客户佣金的收取标准、计算方式等关键信息，确保客户对佣金有充分的了解。如果证券公司未履行告知义务，或者佣金收取标准不透明、不合理，那么客户有权向证券公司提出异议，并要求调整佣金比例。
监管要求：证券公司收取佣金的行为还受到证券监管机构的监管。如果证券公司违反相关规定收取佣金，如存在欺诈、操纵市场等违法行为，那么证券监管机构将依法对其进行处罚，并可能要求证券公司退还多收的佣金。
佣金收取的合法性判断
在判断证券公司收取千分之三佣金是否合法时，我们需要考虑以下几个方面：
是否符合市场惯例：如果千分之三的佣金比例在市场上是普遍接受的，且没有客户对此提出异议，那么可以认为该佣金比例是合理的。
是否履行告知义务：证券公司是否在与客户签订协议时明确告知了佣金的收取标准、计算方式等关键信息。如果证券公司未履行告知义务，那么客户有权要求调整佣金比例或寻求法律救济。
是否存在违法行为：证券公司是否存在欺诈、操纵市场等违法行为。如果存在这些行为，那么无论佣金比例是多少，都是不合法的。
建议与注意事项
了解佣金比例：在签订证券交易委托协议前，客户应仔细了解证券公司的佣金收取标准、计算方式等关键信息，确保自己对佣金有充分的了解。
比较不同证券公司：客户可以比较不同证券公司的佣金比例和服务质量，选择最适合自己的证券公司进行交易。
保留相关证据：如果客户对证券公司的佣金收取有异议，应保留好相关证据（如协议、交易记录等），以便在需要时寻求法律救济。
如果你对证券公司收取的佣金比例有疑问或认为存在不合理之处，可以直接向我咨询，我会根据你的具体情况为你提供专业的法律建议。