结论：甲方欠工程款直接给材料商，这一行为在法律上并不被直接允许，除非存在特定的合法约定或法律情形。

详细分析：

1. 合同相对性原则：

   • 在建设工程合同中，甲方（发包人）与乙方（承包人）之间存在明确的合同关系。工程款是甲方根据合同约定应支付给乙方的款项，用于乙方完成工程建设任务。
   • 根据合同相对性原则，甲方应直接向乙方支付工程款，而不是直接支付给材料商或其他第三方。除非合同中有特别约定，或者乙方明确指示甲方将款项支付给材料商。

2. 合法约定或指示：

   • 如果甲方与乙方在合同中明确约定，或者乙方在合同履行过程中向甲方发出书面指示，要求甲方将部分或全部工程款直接支付给材料商，那么甲方可以按照约定或指示进行支付。
   • 在这种情况下，甲方应确保支付行为符合合同约定和乙方的指示，并保留好相关证据，以避免未来可能出现的纠纷。

3. 法律后果与风险：

   • 如果甲方未经乙方同意，擅自将工程款支付给材料商，这可能构成违约行为。乙方有权要求甲方继续履行合同，支付剩余的工程款，并可能要求甲方承担违约责任。
   • 此外，如果甲方支付给材料商的款项超出了乙方应得的工程款范围，或者甲方与材料商之间存在其他不正当交易，甲方还可能面临法律风险和财务损失。

4. 建议与操作：

   • 对于甲方而言，为了避免纠纷和风险，应严格按照合同约定向乙方支付工程款。如果确实需要向材料商支付款项，应事先与乙方协商并达成一致意见，或者要求乙方出具书面指示。
   • 对于乙方而言，应密切关注工程款的支付情况，确保甲方按照合同约定支付款项。如果发现甲方擅自将款项支付给材料商或其他第三方，应及时与甲方沟通并采取措施维护自身权益。

特殊情况说明：

• 在某些特殊情况下，如乙方因资金问题无法及时支付材料款，且甲方同意代为支付以保障工程进度，这种情况下甲方支付给材料商的行为可能被视为合法。但即便如此，也应确保有明确的书面协议或指示作为依据。

总结与建议：

• 甲方欠工程款直接给材料商的行为在法律上并不被直接允许，除非存在特定的合法约定或法律情形。
• 为了避免纠纷和风险，甲方和乙方应严格按照合同约定履行各自义务，并在必要时进行充分沟通和协商。
• 如果您在建设工程款纠纷方面遇到任何问题或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。