结论：领导干部配偶开公司，子女在其公司工作，是否算违规经营，不能一概而论，需结合具体情况判断。以下从不同角度进行分析：

1. 从公司经营合规性角度：

   • 如果领导干部的配偶所开的公司，其经营活动完全符合法律法规，没有利用领导干部的职权或影响力进行不正当竞争、获取非法利益等行为，那么子女在公司工作本身并不构成违规经营。
   • 关键在于公司的经营活动是否合法合规，以及是否存在利用领导干部职权或影响力进行不正当经营的情况。如果公司经营合法，且子女在公司的工作是基于其自身能力和市场选择，那么就不存在违规经营的问题。

2. 从领导干部廉洁自律角度：

   • 领导干部需要遵守廉洁自律的规定，包括不得利用职权或影响力为亲属谋取私利。如果领导干部的配偶开公司，且子女在公司工作，而领导干部利用职权或影响力为公司谋取不正当利益，或者子女在公司的工作是基于领导干部的职权或影响力而非其自身能力，那么这就可能构成违规行为。
   • 例如，如果领导干部利用职权为公司承揽业务、提供便利条件，或者子女在公司担任与其能力不符的高管职位并获取高额薪酬，这些都可能违反廉洁自律的规定。

3. 从具体规定和案例角度：

   • 具体是否违规，还需参考相关的党纪国法规定以及具体案例。例如，《中国共产党纪律处分条例》等党内法规对领导干部利用职权或影响力为亲属谋取私利的行为有明确规定，并规定了相应的处分措施。
   • 在实际案例中，如果领导干部的配偶开公司且子女在公司工作，同时存在利用领导干部职权或影响力进行不正当经营的情况，那么相关领导干部可能会受到党纪国法的处分。

法律建议：

• 对于领导干部及其配偶、子女来说，应严格遵守法律法规和廉洁自律的规定，确保公司经营活动的合法合规性。
• 如果领导干部的配偶开公司且子女在公司工作，应避免利用领导干部的职权或影响力进行不正当经营或谋取私利。
• 如果存在疑问或不确定的情况，建议及时咨询专业律师或相关机构，以确保合规经营并避免潜在的法律风险。

可能后果：

• 如果领导干部的配偶开公司且子女在公司工作，同时存在违规经营或利用领导干部职权谋取私利的情况，那么相关领导干部可能会受到党纪国法的处分，包括警告、记过、降级、撤职甚至开除党籍等。
• 同时，公司也可能面临法律责任和声誉损失等后果。因此，应严格遵守法律法规和廉洁自律的规定，确保合规经营。