在一级甲等医疗事故中，若医院被认定为次要责任，其赔偿方式主要依据责任比例、具体损失项目及相关法律法规来确定。以下从赔偿项目、责任比例、赔偿流程三个角度为您详细说明：
一、赔偿项目
根据《医疗事故处理条例》及相关司法解释，一级甲等医疗事故（即造成患者死亡或重度残疾）的赔偿项目主要包括：
- 医疗费：因医疗事故导致的人身损害进行治疗所发生的实际医疗费用，不包括原发病医疗费用。结案后如需继续治疗，按基本医疗费用支付。
- 误工费：患者有固定收入的，按因误工减少的固定收入计算；无固定收入的，按医疗事故发生地上一年度职工年平均工资计算。
- 住院伙食补助费：按医疗事故发生地国家机关一般工作人员的出差伙食补助标准计算。
- 陪护费：患者住院期间需要专人陪护的，按医疗事故发生地上一年度职工年平均工资计算。
- 丧葬费：按医疗事故发生地规定的丧葬费补助标准计算。
- 被扶养人生活费：以死者生前或残疾者丧失劳动能力前实际扶养且无劳动能力的人为限，按其户籍所在地或居所地居民最低生活保障标准计算。
- 交通费与住宿费：按患者实际必需的交通费用和住宿费用计算，凭据支付。
- 精神损害抚慰金：按医疗事故发生地居民年平均生活费计算，造成患者死亡的，赔偿年限最长不超过6年。
二、责任比例
在司法实践中，次要责任的赔偿比例通常在20%-40%之间，具体由法院根据案件情况裁定。这一比例反映了医院在医疗事故中的过错程度，是计算最终赔偿金额的关键因素。
计算公式：
$\( \text{最终赔偿金额} = \sum (\text{各项赔偿项目金额}) \times \text{责任比例} \)$
三、赔偿流程
协商解决：
- 医患双方可基于平等、自愿原则进行沟通和协商，就赔偿金额、支付方式等达成一致。
- 双方应签订书面协议，明确权利义务，避免后续纠纷。
行政处理：
- 若协商无果，患者家属可向卫生行政部门提出医疗事故争议处理申请。
- 卫生行政部门将进行调查，并可能委托医学会进行技术鉴定，出具鉴定结论。
- 根据调查结果和鉴定结论，卫生行政部门将对医疗机构和医务人员作出行政处理决定，并调解民事争议。
民事诉讼：
- 患者家属有权直接向人民法院提起民事诉讼，要求医疗机构承担赔偿责任。
- 法院将按照法定程序审理案件，双方当事人进行举证、质证和辩论。
- 法院根据证据和法律规定作出判决，确定医疗机构的赔偿责任。
- 如医疗机构不履行法院判决，患者家属可申请强制执行。
四、特别提示
- 证据收集：在赔偿过程中，患者家属应尽可能收集与医疗事故相关的证据，如医疗记录、鉴定报告、费用凭证等，以支持其赔偿请求。
- 专业咨询：由于医疗事故赔偿涉及复杂的法律问题和医学知识，建议患者在处理过程中寻求专业律师的帮助，以确保权益得到充分保障。
希望以上解答能对您有所帮助。如果您在医疗事故赔偿方面还有其他疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。