结论：保险公司是否会在结算时扣回超出1.8万元的医疗费用，需结合保险合同条款、事故责任划分及是否存在免责情形综合判断，具体分以下三种情况分析：

1. 若保险合同明确约定“医疗费用限额1.8万元”，且事故责任在己方

• 合同条款优先：若保险合同中明确约定“医疗费用赔偿限额为1.8万元”（常见于交强险或部分商业险），超出部分保险公司通常不予承担。此时，若事故责任在己方，超出1.8万元的医疗费需由己方自行承担，保险公司不会在结算时“扣回”（因未赔付过超出部分），但若己方已垫付，可能需通过其他途径（如向对方追偿）解决。
• 例外情形：若合同中未明确限额，或限额高于实际费用（如商业三者险保额充足），则保险公司应全额赔付，不存在扣回问题。

2. 若事故责任在对方，且对方保险覆盖超出部分

• 责任划分是关键：根据《道路交通安全法》第76条，机动车之间发生事故，超出交强险限额的部分由过错方承担。若对方全责，其交强险和商业三者险应覆盖全部医疗费用（包括超出1.8万元部分），此时己方保险公司无需赔付，也不存在扣回问题。
• 实务操作：若对方保险未及时赔付，己方保险公司可能先行垫付（需签订权益转让书），后续由保险公司向对方追偿，但不会从己方已获赔的款项中扣回。

3. 若存在免责情形（如酒驾、无证驾驶等）

• 保险公司拒赔：根据《机动车交通事故责任强制保险条例》第22条，若驾驶人存在酒驾、无证驾驶等情形，保险公司仅在医疗费限额内垫付抢救费用，并有权向致害人追偿。此时，超出1.8万元的部分若保险公司未赔付，则无需扣回；若已垫付，可能通过法律程序向责任人追偿。

建议行动

1. 核查保险合同：重点查看“医疗费用赔偿限额”“免责条款”等内容，确认保险公司赔付范围。
2. 固定证据：保存医疗费发票、诊断证明、事故责任认定书等材料，以便后续主张权利。
3. 协商或诉讼：若与保险公司对赔付金额有争议，可先协商；协商不成，可向当地银保监会投诉或提起诉讼。

提示：保险理赔涉及合同条款、事故责任、免责情形等多重因素，建议根据具体情况进一步分析。若有疑问，可直接向我咨询，我会结合您的案件细节提供针对性建议。