房屋回购协议在符合法律规定且双方自愿、平等、真实表达意思的前提下是合法的，对双方当事人具有法律约束力。不过，其合法性也取决于多个具体因素，以下从不同角度为你详细分析：
一、房屋回购协议合法性的基础条件
基于意思自治：
- 根据《中华人民共和国民法典》第五条，民事主体从事民事活动应遵循自愿原则。房屋回购协议如果是买卖双方在平等、自愿、协商一致的基础上签订的，且是双方真实意思的表示，那么该协议具备基本的合法性。例如，双方因资金周转需要，自愿约定在一定期限后由卖方回购房屋，这样的协议在双方意思表示真实的情况下是合法的。
不违反法律法规强制性规定：
- 依据《中华人民共和国民法典》第一百四十三条，有效的民事法律行为不得违反法律、行政法规的强制性规定，不违背公序良俗。房屋回购协议的内容必须合法，不得损害国家、集体和他人的合法权益。比如，协议中约定的回购价格不能明显低于市场价格以逃避税收，否则可能因违反法律法规而被认定为无效。
明确双方身份与资格：
- 签订房屋回购协议的双方必须具备完全民事行为能力，且具备签订和履行协议的资格。这是确保协议有效性的重要前提。例如，未成年人或精神病人签订的协议可能因主体不适格而无效。
二、房屋回购协议应包含的关键内容
为了确保协议的合法性和有效性，房屋回购协议应明确、具体地包含以下条款：
- 房屋的基本情况：如位置、面积、产权等，这是确定回购标的物的基础。
- 回购价格及计算方式：应明确约定回购价格是原价、原价加利息还是其他计算方式，以避免后续争议。
- 回购期限与付款方式：约定回购的具体期限和付款方式，如一次性付款或分期付款等。
- 违约责任与争议解决机制：明确双方违约时应承担的责任以及争议解决的方式，如仲裁或诉讼等。
三、可能影响房屋回购协议合法性的情形
主体不适格：
- 如果签订房屋回购协议的一方为无民事行为能力人，根据《中华人民共和国民法典》第一百四十四条，该协议将无效。例如，未成年人或精神病人签订的回购协议可能因主体不适格而被认定为无效。
意思表示不真实：
- 如一方以欺诈、胁迫的手段或乘人之危使对方在违背真实意思的情况下订立协议，受损害方有权请求法院或仲裁机构变更或撤销协议。例如，卖方以虚假信息诱使买方签订回购协议，买方在发现真相后有权请求撤销该协议。
违反法律法规强制性规定：
- 协议中约定的回购价格若明显低于市场价格且旨在逃避税收等违法行为，或因房屋本身存在不得转让的情形而签订的回购协议，均可能因违反法律法规而被认定为无效。例如，经济适用房等保障性住房未满上市交易年限的回购约定可能无效。
损害公共利益或他人合法权益：
- 若房屋回购协议的履行会损害社会公共利益或侵害其他第三人的合法权益，该协议也可能被认定为无效。例如，回购协议导致房屋被非法占用或破坏公共设施等。
四、签订与执行房屋回购协议时的注意事项
严格遵守法律法规：
- 在签订和执行回购协议时，双方应严格遵守国家关于房地产交易的法律法规，如《中华人民共和国城市房地产管理法》等。确保协议内容合法合规，避免因违反法律法规而导致协议无效。
办理相关手续：
- 根据当地法律法规的要求，可能需要办理登记、备案或审批等手续。双方应及时按规定办理这些手续以确保协议的合法性和有效性。例如，涉及不动产的回购协议建议办理预告登记以增强对抗第三人的效力。
总结：房屋回购协议在符合法律规定且双方自愿、平等、真实表达意思的前提下是合法的。然而，在实际操作中，双方需谨慎对待每一个细节，确保协议的合法性、有效性和可执行性。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。