关于公司男女员工不正当关系的处理，首先需要明确的是，公司并非法律机构，不能直接对员工之间的私人关系进行法律定性或处罚。但公司可以从内部管理、规章制度以及维护工作秩序的角度出发，合理、合法地处理此类问题。以下是从不同角度给出的分析和建议：

1. 公司规章制度的角度：

   • 规章制度内容：公司可以在规章制度中明确规定，员工之间应保持良好的职业操守，禁止发生不正当关系，尤其是当这种关系影响到工作秩序、团队合作或公司形象时。
   • 规章制度制定程序：规章制度的制定需遵循民主程序，即经过职工代表大会或全体职工讨论，与工会或职工代表平等协商确定，并公示或告知劳动者。
   • 规章制度执行：一旦发现员工违反规章制度中的相关规定，公司可以依据规章制度进行相应的处理，如警告、记过、降职、解雇等。但处理时需确保程序合法，证据充分，避免侵犯员工的合法权益。

2. 劳动合同的角度：

   • 劳动合同内容：在劳动合同中，公司可以与员工约定，员工应遵守公司的规章制度，包括关于员工之间关系的规定。
   • 劳动合同解除：如果员工的不正当关系严重违反了公司的规章制度，且该规章制度符合法律、法规的规定，公司有权依据《劳动合同法》的相关规定，解除与员工的劳动合同。但解除前需确保已履行了法定的程序，如提前通知、听取工会意见等。

3. 法律责任的角度：

   • 民事责任：如果员工的不正当关系导致了公司财产损失或名誉损害，公司可以要求相关员工承担民事赔偿责任。但需注意，这需要公司能够证明损失与员工行为之间的因果关系。
   • 刑事责任：在极少数情况下，如果员工的不正当关系涉及到了违法犯罪行为（如性骚扰、强奸等），公司应立即向公安机关报案，由司法机关依法处理。此时，公司需配合司法机关的调查工作，提供必要的证据和信息。

4. 实际操作建议：

   • 加强教育宣传：公司可以通过培训、讲座等方式，加强对员工的职业道德教育，提高员工的法律意识和道德水平，预防不正当关系的发生。
   • 建立投诉机制：公司可以建立匿名投诉机制，鼓励员工对发现的不正当关系进行举报。对于举报属实的，公司应给予举报人适当的奖励和保护。
   • 及时处理：一旦发现员工之间存在不正当关系，公司应及时进行调查核实，并根据调查结果依法依规进行处理。处理过程中需保持公正、公平、公开的原则，避免引发不必要的争议和纠纷。

最后需要强调的是，公司在处理员工不正当关系问题时，必须确保所有行动都符合法律、法规的规定，尊重和保护员工的合法权益。如果公司在处理过程中存在违法行为或侵犯员工权益的行为，将可能面临法律责任和声誉损失。因此，建议公司在处理此类问题时，务必谨慎行事，必要时可咨询专业律师的意见。

如果您在处理此类问题时遇到任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。