运输公司如果虚开发票，将会面临一系列严重的法律责任，这些责任涵盖了行政、刑事、民事以及信用惩戒等多个方面。以下是对这些责任的详细梳理：

一、行政责任

1. 没收违法所得：税务机关会没收运输公司通过虚开发票所获得的全部违法收入。

2. 罚款：

   • 如果虚开金额在1万元以下，运输公司可能会被并处5万元以下的罚款。
   • 如果虚开金额超过1万元，罚款金额将提升至5万元以上50万元以下。

3. 其他处罚：税务机关还可能采取停止供应发票、公告等处罚措施。对于情节严重构成犯罪的，税务机关会依法移送司法机关处理，并在相关场所或媒体上进行公告。

二、刑事责任

虚开发票行为如果构成犯罪，运输公司及其相关责任人员将面临刑事追责：

1. 虚开增值税专用发票、用于骗取出口退税、抵扣税款发票罪：

   • 行为界定：包括为他人虚开、为自己虚开、让他人为自己虚开、介绍他人虚开等行为，涉及增值税专用发票及具有出口退税、抵扣税款功能的其他发票。
   • 量刑标准：根据虚开税款数额或造成国家税款损失的金额，运输公司可能面临三年以下有期徒刑或拘役，并处二万元以上二十万元以下罚金；情节严重的，刑罚将更重，甚至可能面临无期徒刑。

2. 虚开发票罪：

   • 行为界定：虚开除上述发票以外的其他发票，且情节严重的行为。
   • 量刑标准：情节严重的，运输公司可能面临二年以下有期徒刑、拘役或者管制，并处罚金；情节特别严重的，刑罚将提升至二年以上七年以下有期徒刑，并处罚金。
   • 单位犯罪：如果运输公司作为单位犯此罪，将对单位判处罚金，并对其直接负责的主管人员和其他直接责任人员依法处罚。

三、民事责任

如果因虚开发票导致对方公司遭受经济损失，运输公司需要承担民事赔偿责任。此外，因虚开发票引发的诉讼，运输公司还需承担诉讼费用和律师费用等。

四、信用惩戒

运输公司虚开发票还将面临信用惩戒。税务机关会将公司的违法行为记录在案，这可能影响公司的信用评级和未来的业务合作。在某些情况下，公司甚至可能被列入失信被执行人名单，受到更多的限制和惩戒。

总结与建议

运输公司虚开发票的法律责任是全方位的，不仅涉及行政处罚和刑事责任，还包括民事责任和信用惩戒。因此，我强烈建议运输公司在日常经营中严格遵守相关法律法规和税收政策，确保发票管理的规范性和合法性。如果发现任何虚开发票的行为，应立即采取措施制止，并向相关部门报告，以维护自身合法权益和社会秩序。