有限责任公司（自然人独资）在初始设立时，其股东仅为一个自然人，但后续可以通过法定程序增加股东，从而变更为普通的有限责任公司。以下是对这一问题的详细分析：

一、初始设立时的股东情况

有限责任公司（自然人独资）在设立时，其股东仅为一个具有完全民事行为能力的自然人。这个自然人股东对公司的全部财产拥有所有权，并需以其个人财产对公司债务承担无限责任。这是自然人独资公司的一个显著特点。

二、增加股东的可能性与流程

1. 可能性： 自然人独资公司并非一成不变，它可以通过法定程序增加股东，从而变更为普通的有限责任公司。这一过程需要满足一定的法律条件，并遵循相应的法律程序。

2. 流程：

   • 修订公司章程：首先，需要对公司章程进行修订，以适应增加股东后的情况。这包括修改股东人数、股东的权利义务等事项。对于一人公司来说，这一决定由原自然人股东作出即可。
   • 签署相关协议：新股东与原股东之间需要签署股权协议，明确各自的出资方式、出资额、股权比例等重要事项。这是确保双方权益的关键步骤。
   • 办理工商变更登记：接下来，需向当地工商行政管理部门提交一系列变更登记申请材料，包括但不限于修改后的公司章程或公司章程修正案、股东身份证明文件、股东会议决议（对于一人公司即为原自然人股东的决定）、股权协议等。工商部门审核通过后，会进行相应的登记变更，并换发新的营业执照。此时，公司性质就从自然人独资公司变更为普通有限责任公司，股东人数也随之增加。

三、增加股东后的法律后果

1. 公司治理结构的变化： 增加股东后，公司需要按照普通有限责任公司的要求调整公司治理结构，如设立董事会、监事会等机构，并明确各机构的职责和权限。

2. 财务规范的要求： 普通有限责任公司需要遵循更为严格的财务规范，如定期编制财务报表、接受审计等。自然人独资公司变更为普通有限责任公司后，也需要满足这些要求。

3. 股东责任的承担： 在普通有限责任公司中，股东以其出资额为限对公司债务承担责任。这与自然人独资公司中股东需以其个人财产对公司债务承担无限责任的情况有所不同。因此，增加股东后，原自然人股东的责任范围将有所缩小。

四、注意事项

• 在增加股东的过程中，应确保所有文件的真实性和合法性，以避免后续的法律风险。
• 变更登记完成后，公司应及时更新相关信息，如税务登记、银行账户等，以确保公司的正常运营。
• 如果对增加股东的具体流程或法律后果存在疑问，建议直接向我咨询，以便获得更专业、更具体的法律建议。

综上所述，有限责任公司（自然人独资）在初始设立时股东仅为一个自然人，但后续可以通过法定程序增加股东并变更为普通的有限责任公司。这一过程需要满足一定的法律条件并遵循相应的法律程序，同时需要注意公司治理结构、财务规范以及股东责任承担等方面的变化。