结论：甲乙双方在签订合同时，一方盖公章而另一方盖合同章，这种做法在法律上是可行的，但具体是否有效还需根据合同内容、双方意图及实际履行情况等因素综合判断。

详细分析：

1. 公章与合同章的法律效力：

   • 公章：公章是单位或组织的正式印章，具有最高的法律效力。在合同上加盖公章，通常代表单位或组织对合同内容的认可和承诺。
   • 合同章：合同章是专门用于签订合同的印章，其法律效力与公章在合同领域内相当。加盖合同章，同样表示对合同内容的确认和接受。

2. 盖章方式的合法性：

   • 根据《中华人民共和国民法典》及相关法律法规，合同的有效成立通常要求双方意思表示真实、一致，且不违反法律、行政法规的强制性规定。盖章作为确认合同内容的一种方式，只要双方自愿、合法地使用各自的印章，且印章真实有效，就不影响合同的法律效力。
   • 因此，一方盖公章而另一方盖合同章，并不违反法律强制性规定，这种做法在法律上是可行的。

3. 合同效力的综合判断：

   • 尽管盖章方式合法，但合同的效力还需根据合同内容、双方意图及实际履行情况等因素综合判断。例如，如果合同内容存在违法或违背公序良俗的条款，即使双方盖章，合同也可能被认定为无效。
   • 另外，如果一方在盖章时存在欺诈、胁迫等情形，或者盖章并非其真实意思表示，那么该方可能有权主张合同无效或撤销合同。

4. 实际建议：

   • 在签订合同时，双方应确保使用的印章真实有效，并明确各自的权利和义务。
   • 如果对盖章方式或合同内容存在疑问，建议咨询专业律师或法律机构，以确保合同的合法性和有效性。
   • 在合同履行过程中，双方应遵守合同约定，及时沟通解决可能出现的问题，以维护双方的合法权益。

总结：甲乙双方在签订合同时，一方盖公章而另一方盖合同章，这种做法在法律上是可行的。但合同的效力还需根据合同内容、双方意图及实际履行情况等因素综合判断。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。