结论：虽然法律并未明确禁止合同章和公章同时加盖在一份合同上，但在实际操作中，建议根据合同的具体内容和性质选择合适的印章进行加盖，以避免引发不必要的法律疑问或纠纷。
一、法律层面分析
合同效力不受影响：
- 根据我国法律规定，合同的有效性主要取决于双方当事人的民事行为能力、意思表示的真实性、合同内容的合法性以及不违背公序良俗等原则。盖章只是证明合同成立的一种方式，因此，同时加盖合同章和公章并不会直接影响合同的法律效力。
无明文禁止：
- 法律并未明确规定不能同时加盖合同章和公章，这意味着在理论上，这样的做法并不违法。
二、实践操作层面分析
增强合同证明力（特定情况）：
- 在某些重大合同或涉及高风险、大额交易的场合，同时加盖合同章和公章可能被视为增强合同证明力的方式，显示公司对合同的重视，提升合同相对方的信心。但这种情况并不常见，且需谨慎操作。
适应交易习惯和要求（特定情况）：
- 不同地区、行业及交易主体可能存在不同的交易习惯和要求。有时，为了满足交易相对方的内部管理或风险控制需求，可能需要同时加盖合同章和公章以符合其审查标准。然而，这并非普遍做法，且应事先与交易相对方明确沟通。
推荐做法：
- 为避免不必要的麻烦和误解，建议根据合同的具体内容和性质选择合适的印章进行加盖。一般而言，经济合同应加盖合同章，而需要证明公司身份的场合则应使用公章。
三、潜在风险与建议
避免混淆与误解：
- 同时加盖两种印章可能导致对合同签署意图的混淆，甚至让第三方对合同的有效性产生怀疑。这可能给合同的执行带来复杂性，并增加法律风险。
简化流程与降低风险：
- 为了确保合同的合法性和有效性，并降低潜在的法律风险，建议公司在签订合同时选择使用一种印章（通常是合同章），以确保合同的清晰性和一致性。
建立完善的印章管理制度：
- 公司应明确授权特定人员管理和使用印章，确保印章使用的安全性和合规性。同时，建立完善的印章管理制度，包括印章的刻制、保管、使用和销毁等环节，以确保印章管理的规范性和严谨性。
四、特殊情况处理
- 如果确实需要在一份合同上同时加盖合同章和公章（例如，应交易相对方的特殊要求），建议在合同中明确注明这种情况的处理方式及效力，以减少法律风险。同时，应确保这种做法符合公司的内部管理制度和交易习惯。
总结：虽然法律上并未禁止合同章与公章的同时加盖，但在实际操作中应谨慎行事。公司应根据合同的具体内容和性质选择合适的印章进行加盖，并建立完善的印章管理制度。如有任何疑问或需要进一步的法律建议，请直接向我咨询。