公司注销后，原有已进入执行程序的案件原则上不会因公司注销而自然终结，执行程序仍可继续，但具体处理方式需根据公司注销时的清算情况及法律程序来确定。以下从不同角度进行详细分析：

1. 若公司未经合法清算即注销：

   • 法律后果：根据《公司法》及相关司法解释，公司未经清算即办理注销登记，导致公司无法进行清算的，债权人可以主张有限责任公司的股东、股份有限公司的董事和控股股东，以及公司的实际控制人对公司债务承担清偿责任。
   • 执行程序处理：在此情况下，执行法院可以裁定变更或追加有限责任公司的股东、股份有限公司的董事和控股股东，以及公司的实际控制人为被执行人，继续执行其财产以清偿债务。

2. 若公司经过合法清算但未通知债权人即注销：

   • 法律后果：清算组应当自成立之日起十日内通知债权人，并于六十日内在报纸上公告。债权人应当自接到通知书之日起三十日内，未接到通知书的自公告之日起四十五日内，向清算组申报其债权。如果清算组未依法履行通知和公告义务，导致债权人未及时申报债权而未获清偿的，债权人同样可以主张清算组成员对因此造成的损失承担赔偿责任。
   • 执行程序处理：债权人可以向执行法院申请变更或追加清算组成员为被执行人，要求其承担赔偿责任，并继续执行其财产。

3. 若公司经过合法清算且已通知债权人，但注销后仍有未清偿债务：

   • 法律后果：在公司已依法进行清算，且债权人已依法申报债权的情况下，如果公司财产不足以清偿全部债务，根据《公司法》及《企业破产法》的相关规定，公司应进入破产程序（如果尚未进入）或按照破产清算程序处理剩余债务。但若公司已注销，且未进入破产程序，则债权人可能面临无法直接通过公司财产获得清偿的情况。
   • 执行程序处理：在此情况下，执行法院可能会裁定终结本次执行程序，并告知债权人可通过其他法律途径（如起诉股东、清算组成员等）寻求救济。如果债权人发现公司注销前存在隐匿、转移财产等逃避债务的行为，还可以向法院申请恢复执行或提起相关诉讼。

4. 特殊情况下的处理：

   • 如果公司注销后，其股东或第三人承诺对公司债务承担偿还责任：在这种情况下，债权人可以直接向承诺人主张权利，执行法院也可以根据债权人的申请，裁定变更或追加承诺人为被执行人。
   • 如果公司注销后，发现公司存在未了结的民事诉讼或仲裁案件：根据相关法律规定，公司注销后，其民事诉讼或仲裁案件的诉讼主体资格消灭，但案件本身并不因此而终结。如果案件已进入执行程序，执行法院可以继续执行公司剩余财产（如果有的话），或者根据具体情况变更或追加被执行人。