结论：违反《土地管理法》第五十六条的合同，其效力可能因具体情况而异，一般可能被认定为无效或部分无效，但具体还需结合合同内容、违反条款的性质及后果等因素综合判断。
分析：
《土地管理法》第五十六条的内容：
- 该条款主要规定了建设单位使用国有土地的，应当按照土地使用权出让等有偿使用合同的约定或者土地使用权划拨批准文件的规定使用土地；确需改变该幅土地建设用途的，应当经有关人民政府自然资源主管部门同意，报原批准用地的人民政府批准。其中，在城市规划区内改变土地用途的，在报批前，还应当先经有关城市规划行政主管部门同意。
违反该条款的合同效力：
- 无效情形：如果合同内容直接违反了《土地管理法》第五十六条的强制性规定，且该违反行为导致了合同目的无法实现或损害了国家、集体或第三人的利益，那么该合同可能被认定为无效。例如，合同中约定未经批准擅自改变土地用途，且该改变行为明显违反了土地利用总体规划和城市规划，这样的合同很可能被认定为无效。
- 部分无效情形：如果合同中只是部分条款违反了《土地管理法》第五十六条的规定，而其他部分仍然合法有效，且可以独立存在，那么可能只是违反条款的部分被认定为无效，而合同的其他部分仍然有效。例如，合同中既包含了合法的土地使用条款，也包含了未经批准擅自改变土地用途的违法条款，那么可能只是违法条款部分无效，而合法条款部分仍然有效。
- 可撤销或可变更情形：在某些情况下，如果违反《土地管理法》第五十六条的行为并非出于故意或重大过失，且该违反行为并未导致合同目的无法实现或损害国家、集体或第三人的利益，那么该合同可能被视为可撤销或可变更。但这种情况相对较少，且需要具体案件具体分析。
法律后果与建议：
- 法律后果：一旦合同被认定为无效或部分无效，那么合同中的相关条款将不再具有法律效力，当事人需要承担相应的法律责任，如返还财产、赔偿损失等。
- 建议：在签订涉及土地使用的合同时，务必仔细审查合同内容，确保合同条款符合《土地管理法》等相关法律法规的规定。如果合同中涉及改变土地用途的条款，务必按照法定程序办理相关审批手续，以避免因违反法律法规而导致合同无效或承担法律责任。
进一步思考：
- 在实际操作中，判断合同是否违反《土地管理法》第五十六条以及违反后的合同效力问题，往往需要结合具体的合同内容、违反条款的性质及后果等因素进行综合判断。因此，在遇到类似问题时，建议及时咨询专业律师，以便获得更准确、更全面的法律意见。
- 此外，随着法律法规的不断更新和完善，对于土地使用合同的审查和管理也将更加严格和规范。因此，当事人在签订和履行土地使用合同时，应密切关注相关法律法规的变化，确保合同内容的合法性和有效性。
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