关于居间方收取保证金是否合法的问题，这并非一个简单的“是”或“否”的答案，而是需要依据具体情况和法律规定来综合判断。以下是我为您提供的详细分析：
一、居间费的合法性基础
首先，我们需要明确居间费（或称中介费、佣金）的合法性基础。根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，居间合同的核心是“报告订立合同机会”或“提供订立合同的媒介服务”。如果居间方真实、有效地履行了这些义务，比如促成项目签约、提供透明的服务内容，并依法纳税，那么其收取的居间费是受法律保护的。
二、保证金与居间费的区别
保证金通常是在合同履行过程中，为确保一方履行其义务而由另一方收取的一定金额。它不同于居间费，居间费是居间方因提供居间服务而获得的报酬。因此，居间方收取保证金本身并不是其常规的业务行为，除非在特定情况下，双方有明确的约定，并且该约定不违反法律法规的强制性规定。
三、居间方收取保证金的合法性判断
有明确约定且合法：如果双方在居间合同中明确约定了居间方可以收取保证金，并且该约定符合法律法规的强制性规定（比如不涉及权钱交易、不违反招投标法等），那么居间方收取保证金是合法的。
无明确约定或违法：如果双方没有在居间合同中明确约定居间方可以收取保证金，或者该约定违反了法律法规的强制性规定（比如涉及权钱交易、虚假居间、招投标操纵等），那么居间方收取保证金就是非法的，相关款项可能被追缴，并可能引发民事无效、行政处罚乃至刑事责任。
四、实务建议
明确约定：如果您是委托方或居间方，建议在居间合同中明确约定是否收取保证金、保证金的金额、支付方式、退还条件等，以避免后续纠纷。
合法合规：无论收取何种费用，都应确保行为合法合规，不涉及权钱交易、虚假居间、招投标操纵等违法行为。
保留证据：在合同履行过程中，应保留好相关证据，如沟通记录、会议纪要、成果文件等，以证明自己的履约情况。
综上所述，居间方收取保证金是否合法，取决于双方是否有明确约定且该约定是否合法合规。如果您对此仍有疑问或需要进一步的法律帮助，建议咨询专业律师或相关机构。