在刑事案件中，当被告人选择不认罪认罚时，法院会依据一系列严谨的法律程序和规定来处理案件。以下是对此问题的详细解析：
一、法院的判决依据
以事实为依据：
- 法院的首要任务是查明案件事实。这包括仔细审查控辩双方提供的所有证据，评估证据的真实性、合法性和关联性。
- 法院会判断这些证据是否足以证明被告人实施了犯罪行为，以及犯罪的具体情节，如时间、地点、手段、后果等。
以法律为准绳：
- 在查明案件事实的基础上，法院将严格依据相关法律条款对被告人进行定罪量刑。
- 法律是判决的唯一准则，法院必须确保所有裁决都符合法律规定，不受任何外部因素干扰。
二、法院的具体处理方式
依据证据判决：
- 根据《中华人民共和国刑事诉讼法》的相关规定，法院对案件的判处必须重证据，不轻信口供。
- 即使被告人不认罪，只要控方提供的证据确实、充分，能够形成完整的证据链，法院仍可认定其有罪并处以相应的刑罚。
- 证据需满足严格的标准，包括定罪量刑的事实均有证据证明、据以定案的证据均经法定程序查证属实、综合全案证据对所认定事实已排除合理怀疑。
考虑认罪态度：
- 虽然被告人的认罪态度并非定罪的唯一依据，但它会影响量刑。
- 如果被告人自愿认罪认罚，根据法律规定，可以依法从宽处理。相反，不认罪可能使被告人失去这一从宽机会，法院在量刑时会予以考量。
判决可能性：
- 若证据不足或存在疑点，法院会倾向于保守判决，可能作出无罪判决或要求控方补充证据。
- 若证据确实充分且被告人态度恶劣，法院可能会依法判处较重的刑罚，以体现对犯罪的严厉打击。
三、被告人及其辩护人的应对策略
充分了解案件：
- 辩护人应与被告人充分沟通，了解其不认罪的原因，提供专业的法律意见和辩护策略。
积极辩护：
- 辩护人应积极收集有利于被告人的证据，并在庭审中出示和说明。
- 对控方证据进行仔细质证，指出问题和疑点，削弱其证明力。
保障辩护权利：
- 庭审过程中，被告人及其辩护人应充分发表意见，保障被告人的辩护权利。
- 通过庭审调查、质证和辩论等环节，查明案件事实真相，确保案件得到公正审理。
四、其他注意事项
认罪认罚教育转化：
- 司法人员可能会通过讲解法律政策、分析案件事实和证据、说明认罪认罚的从宽处理等方式，促使被告人转变态度，自愿认罪认罚。
被告人的权利与义务：
- 被告人有权保持沉默，不认罪是其合法权利。
- 但被告人也有义务配合调查，如实陈述事实，不得伪造、隐匿、毁灭证据。
综上所述，当刑事案件中的被告人不认罪认罚时，法院会依据案件事实、证据以及法律规定进行判决。被告人及其辩护人应积极应对，充分行使辩护权利，确保案件得到公正审理。同时，被告人也应了解自己的权利与义务，在律师的帮助下做出明智决策。