在刑事案件二审中发现违法管辖的，其法律依据主要涉及《中华人民共和国刑事诉讼法》及相关司法解释中关于管辖的规定。以下从几个方面进行详细阐述：

1. 违法管辖的定义与情形：

   • 违法管辖通常指的是法院在受理刑事案件时，违反了法律规定的管辖原则或程序，如超越了地域管辖、级别管辖或专门管辖的范围，或者未遵循指定管辖、移送管辖等法定程序。

2. 法律依据：

   • 《中华人民共和国刑事诉讼法》第二十一条至第二十七条：这些条款明确规定了刑事案件的级别管辖原则，即基层人民法院、中级人民法院、高级人民法院和最高人民法院分别管辖的第一审刑事案件的范围。如果二审法院发现一审法院在级别管辖上存在错误，即属于违法管辖。
   • 《中华人民共和国刑事诉讼法》第二十五条：该条款规定了刑事案件的地域管辖原则，即以犯罪地人民法院管辖为主，被告人居住地人民法院管辖为辅。如果二审法院发现一审法院在地域管辖上违反了这一原则，也构成违法管辖。
   • 《中华人民共和国刑事诉讼法》第二十九条：此条款涉及回避制度，虽然不直接规定管辖，但若一审法院因回避问题导致管辖不当（如应回避的法官参与了案件审理，影响了管辖的公正性），二审法院在审查时也可能发现并纠正此类违法管辖情况。不过，更直接的是，若一审法院因回避等事由应将案件移送其他法院审理而未移送，也构成管辖违法。
   • 相关司法解释：如《最高人民法院关于适用〈中华人民共和国刑事诉讼法〉的解释》等，这些司法解释对刑事诉讼法的管辖原则进行了进一步细化和明确，为二审法院审查一审法院是否存在违法管辖提供了具体依据。

3. 二审中发现违法管辖的处理：

   • 裁定撤销原判，发回重审：如果二审法院发现一审法院存在违法管辖的情况，且该违法管辖可能影响了案件的公正审理，二审法院通常会裁定撤销原判，将案件发回原一审法院重新审理，或者指定其他有管辖权的人民法院审理。
   • 直接改判（特殊情况）：在极少数情况下，如果二审法院认为违法管辖并未对案件的公正审理产生实质性影响，且直接改判更有利于节约司法资源、保护当事人权益，二审法院也可能在纠正管辖错误的同时，直接对案件进行改判。但这种情况较为罕见，且需严格符合法律规定的条件。

4. 实际案例与启示：

   • 在实际司法实践中，二审法院发现一审法院存在违法管辖的情况并不罕见。这通常要求二审法院在审理案件时，对一审法院的管辖问题进行严格审查。一旦发现违法管辖，二审法院将依法作出相应处理，以确保案件的公正审理和法律的正确实施。
   • 对于当事人而言，如果认为一审法院存在违法管辖的情况，可以在上诉时提出相关异议，并请求二审法院进行审查。同时，当事人也应了解并掌握相关法律规定，以便更好地维护自己的合法权益。

总结来说，刑事案件二审中发现违法管辖的法律依据主要来源于《中华人民共和国刑事诉讼法》及相关司法解释中关于管辖的规定。二审法院在发现违法管辖时，将依法作出相应处理，以确保案件的公正审理和法律的正确实施。如果您在刑事案件中遇到类似问题，可以直接向我咨询，我会根据您的具体情况提供详细的法律建议。