针对您提出的问题“因女儿有存款把我妈低保取消了，合法吗”，我们可以从以下几个方面进行详细分析：

首先，我们要明确低保制度的基本原则和目的。低保，即最低生活保障制度，是国家为了保障困难群众的基本生活和衣食冷暖而设立的一项社会救助制度。其发放对象、发放标准以及发放条件都是严格规定的，旨在确保救助资源能够精准地到达真正需要帮助的家庭。

接下来，我们分析低保资格的审核标准。通常，低保资格的审核会综合考虑家庭人口、收入、财产和消费支出状况等多个因素。其中，家庭财产状况是审核的重要一环。如果家庭成员拥有一定数额的存款或其他财产，且这些财产超出了当地规定的最低生活保障家庭财产标准，那么该家庭就可能不再符合低保的申领条件。

现在，我们回到您提出的问题上。如果您的母亲因为女儿有存款而被取消了低保资格，这很可能是因为女儿的存款被计入了家庭财产总额，导致整个家庭的财产状况超出了当地规定的低保标准。在这种情况下，民政部门根据相关规定和程序，对您的母亲作出了停发低保的决定，这是合法的。

为了进一步说明这一点，我们可以参考一些实际案例。例如，在重庆市第五中级人民法院审结的一起给付最低生活保障金二审案件中，王某夫妇因家庭存款80多万元且拒不配合核查工作，被民政局暂停了最低生活保障发放。法院最终判决维持了民政局的决定，认为王某夫妇的银行存款已经超过了全市城市最低生活保障标准的24倍，不符合申领最低生活保障家庭财产标准。

此外，辽宁省铁岭市西丰县纪委监委在监督检查时也发现了一起类似案例。胡某因为家庭贫困享受低保，但近几年其子存款已超过百万元，胡某已不再符合享受低保的条件。县纪委监委及时督促民政部门依规核查，并取消了其低保资格。

综上所述，如果您的母亲因为女儿有存款而被取消了低保资格，且这一决定是基于家庭财产状况超出了当地规定的低保标准而作出的，那么这一决定是合法的。当然，如果您对这一决定有异议，您可以向当地民政部门提出申诉或咨询相关法律专业人士以获取更详细的法律建议。