母亲有低保，女儿有存款且户口分开的情况下，一般不会影响母亲的低保资格。以下是对这一结论的详细解释：

1. 低保资格与家庭财产的关系：

   • 低保，即最低生活保障，是针对生活困难的家庭提供的一种经济救助。其资格审核主要关注申请人及其共同生活的家庭成员的收入和财产状况。
   • 在本题中，母亲和女儿的户口已经分开，通常意味着她们在经济上、生活上已经相对独立。因此，女儿的个人财产（包括存款）一般不会被计入母亲的低保资格审核范围。

2. 户口分开的影响：

   • 户口分开是判断家庭成员是否共同生活的一个重要依据。在户口分开的情况下，除非有特别证明表明她们仍然在经济上高度依赖或共同生活，否则一般会被视为两个独立的家庭单位。
   • 既然女儿和母亲的户口已经分开，那么她们各自的财产状况通常不会相互影响对方的低保资格。

3. 特殊情况说明：

   • 当然，也存在一些特殊情况。比如，如果母亲虽然户口与女儿分开，但实际上仍然高度依赖女儿的经济支持，或者女儿的经济状况异常优越且对母亲有明确的赡养义务但未尽到，这些情况可能会影响到母亲的低保资格。
   • 但这些特殊情况需要具体的证据和事实来支持，不能仅凭户口分开就一概而论。

综上所述，母亲有低保，女儿有存款且户口分开的情况下，一般不会影响母亲的低保资格。但如果有特殊情况或疑问，建议及时向当地民政部门或相关机构咨询，以确保权益得到妥善保障。