结论：针对赔偿协议被甲方侵权且剩余赔偿款逾期的情况，乙方可以采取以下措施来维护自身权益：首先，尝试与甲方进行友好协商；其次，若协商无果，可以向有管辖权的人民法院提起诉讼；最后，在诉讼过程中或诉讼前，乙方还可以考虑申请财产保全措施。

详细分析：

1. 友好协商：

   • 法律背景：在民事纠纷中，友好协商是解决争议的首选方式。它有助于双方保持关系和谐，同时节省时间和成本。
   • 建议行动：乙方可以主动与甲方联系，明确指出赔偿款逾期的事实，并要求甲方按照协议约定支付剩余款项。在协商过程中，乙方可以保留相关证据，如赔偿协议、付款记录等，以备不时之需。

2. 提起诉讼：

   • 法律背景：如果协商无果，乙方有权向有管辖权的人民法院提起诉讼，要求甲方支付剩余赔偿款及可能产生的逾期利息或违约金。
   • 建议行动：
     • 准备证据：乙方需要收集并整理所有与赔偿协议相关的证据，包括协议文本、付款记录、沟通记录等。
     • 撰写诉状：乙方需要撰写一份详细的诉状，明确陈述事实、理由和诉讼请求。
     • 提交法院：将诉状及相关证据提交给有管辖权的人民法院，并按照法院的要求缴纳诉讼费用。
   • 可能后果：如果法院认定甲方确实存在违约行为，将判决甲方支付剩余赔偿款及可能产生的逾期利息或违约金。如果甲方拒不履行判决，乙方还可以申请强制执行。

3. 申请财产保全：

   • 法律背景：在诉讼过程中或诉讼前，为了防止甲方转移、隐匿财产，导致判决难以执行，乙方可以向法院申请财产保全措施。
   • 建议行动：
     • 提交申请：乙方需要向法院提交财产保全申请书，并提供相关证据证明甲方存在转移、隐匿财产的风险。
     • 提供担保：根据法院的要求，乙方可能需要提供一定的担保，以确保财产保全措施的合法性和合理性。
     • 等待法院裁定：法院将对乙方的申请进行审查，并作出是否采取财产保全措施的裁定。
   • 可能后果：如果法院裁定采取财产保全措施，将冻结甲方的相关财产，确保判决能够得到有效执行。

额外建议：

• 在整个过程中，乙方应保持冷静和理性，避免采取过激行为或言语攻击甲方，以免加剧矛盾或影响自身权益的维护。
• 如果乙方对法律程序不熟悉或担心自身权益无法得到充分保障，可以考虑聘请一位专业律师协助处理此事。作为专业律师，我可以为乙方提供全面的法律咨询和代理服务，确保乙方的权益得到最大程度的维护。

最后，如果乙方有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。我将根据乙方的具体情况和需求，提供个性化的法律解决方案。