绩效工资本身是合法的，但具体是否合法需结合用人单位的薪酬管理制度、劳动合同约定以及相关法律法规来综合判断。以下是对此问题的详细分析：
合法性依据
法律法规支持：
- 根据《关于工资总额组成的规定》第四条，工资总额由多个部分组成，其中奖金是重要组成部分之一。绩效工资作为对员工工作表现和业绩成果的考核后发放的工资，可归类为奖金范畴。因此，在工资构成中包含绩效工资是符合相关法规对工资组成规定的。
薪酬管理制度：
- 绩效工资制度作为劳动制度、人事制度与工资制度的紧密结合，是国家宏观调控与单位自主分配相结合的产物。只要用人单位的薪酬管理制度中明确规定了绩效工资的计算和支付方式，且不违反法律法规的强制性规定，该制度即合法有效。
合法实施的条件
明确的薪酬管理制度：
- 用人单位应制定明确的绩效工资制度，包括绩效考核的标准、方法、流程以及绩效工资的计算方式等，并将这些内容告知员工。例如，通过员工手册或劳动合同等形式进行详细规定，并确保员工入职时进行培训和签字确认。
合理的绩效考核标准：
- 绩效考核标准应设定得合理、明确，不超出员工正常能力范围，且易于理解和执行。用人单位需有充分的证据证明员工的绩效确实未达到考核标准，如员工签字确认的绩效评估表、工作任务完成记录等。
劳动合同中的明确约定：
- 劳动合同中应明确载明绩效工资与绩效考核结果的挂钩关系，包括具体的挂钩方式和扣减情形。若劳动合同中有此类约定，且用人单位能证明员工绩效未达标，则按照合同约定扣减绩效工资通常是合法的。
保障员工基本权益：
- 即使扣除绩效工资，劳动者的工资收入也不得低于当地最低工资标准，这是保障劳动者基本生活权益的重要底线。
非法情况
缺乏制度依据或未经民主程序：
- 若用人单位没有相关的绩效考核制度，或虽有制度但未经法定的民主程序制定，则随意以绩效考核为由扣绩效工资是不合法的。
考核标准不合理或不明确：
- 绩效考核标准若设定得过于苛刻、不合理，或模糊不清，使员工无法明确知道如何达到考核要求，则以此为依据扣减绩效工资是不合法的。
滥用绩效考核扣工资：
- 用人单位不得以绩效考核为手段进行恶意扣减或无故克扣工资，如为降低成本而故意将大部分员工评定为不达标并扣绩效工资，这种行为是违法的。
劳动合同或规章制度无相关约定：
- 若劳动合同或企业规章制度中没有明确约定绩效工资，或用人单位单方面从原有固定工资中拆分出一部分作为绩效工资，则无权以绩效考核为由扣除绩效工资。
实际建议
- 对于用人单位：应确保绩效考核制度的合理性、合法性及透明性，明确告知员工绩效考核的标准、方法及绩效工资的计算方式，并在劳动合同中明确约定相关条款，以避免不必要的法律纠纷。
- 对于员工：应了解自己的权益，仔细阅读劳动合同和员工手册中的相关条款。若认为用人单位扣减绩效工资的行为不合法或存在争议，可先尝试与用人单位沟通协商；协商无果时，可向当地劳动行政部门投诉或申请劳动仲裁以维护自身权益。
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