在对方不配合做亲子鉴定的情况下，处理方式需结合具体场景和法律程序来分析，以下是详细说明：

1. 诉讼场景下的处理方式
   若涉及离婚、抚养权纠纷或继承权争议等诉讼案件，一方拒绝配合亲子鉴定时，法院可能通过推定规则作出判断。根据《民法典婚姻家庭编解释（一）》第39条，若父或母以及成年子女起诉请求确认亲子关系，且已提供必要证据（如同居记录、出生证明、证人证言等），而另一方无相反证据又拒绝做亲子鉴定的，法院可推定请求确认亲子关系一方的主张成立。
   操作建议：

   • 收集间接证据：如双方同居期间的聊天记录、共同出行记录、邻居证言、孕期产检陪同记录等，证明存在亲密关系或生育关联性；
     
   • 申请法院委托鉴定：向法院提交书面申请，由法院向对方送达《亲子鉴定通知书》，若对方仍拒绝，法院可结合其他证据综合认定亲子关系。

2. 非诉讼场景下的处理方式
   若未进入诉讼程序（如私下协商抚养费或探视权），对方拒绝配合时，无法直接强制其接受鉴定，但可通过以下途径间接推动：

   • 协商沟通：明确告知对方亲子鉴定对明确权利义务的重要性（如抚养费支付、继承权分配等），尝试通过书面协议约定配合鉴定的义务；
     
   • 委托律师发函：由律师向对方发送正式函件，说明拒绝鉴定的法律后果（如可能承担不利推定责任），增加其心理压力；
     
   • 收集其他证据：若对方拒绝鉴定，可优先收集其他能证明亲子关系的证据（如血缘关系证明、共同生活照片、视频等），为后续诉讼做准备。

3. 特殊情况：涉及未成年人时的处理
   若鉴定涉及未成年人，需优先保护其权益。根据《未成年人保护法》第103条，不得对未成年人实施与身份确认无关的强制鉴定。若对方以保护孩子为由拒绝，需评估鉴定必要性：

   • 若孩子已满8周岁，法院可能征求其意见；
     
   • 若孩子未满8周岁，需证明鉴定对维护其合法权益（如确认抚养权、继承权）具有必要性，否则法院可能不支持强制鉴定。

总结建议：

• 优先通过协商或律师函推动对方配合；
  
• 若进入诉讼，务必提前收集间接证据，并申请法院委托鉴定；
  
• 涉及未成年人时，需平衡鉴定必要性与孩子权益保护。
  

若有具体案件细节（如是否已起诉、证据类型等），可进一步向我说明，我会结合实际情况提供更精准的方案。