结论：六环外误入六环内一天被罚两次是否合理，需结合具体违法情形判断，可能存在合理与不合理两种情况。以下分情况详细说明：

1. 若两次处罚基于不同违法行为，则合理

根据《道路交通安全法》及北京市相关规定，交通违法处罚的核心是“违法行为”而非“车辆位置”。若您在六环外误入六环内后，存在以下两种独立违法行为，则可能被两次处罚：

• 第一次处罚：因“未办理进京证”进入六环内（根据北京市限行规定，外地车辆进入六环内需办理进京证，否则罚款100元并扣3分）。
• 第二次处罚：在六环内行驶过程中，因其他违法行为（如违反禁令标志、超速、未按规定车道行驶等）被再次处罚。

法律依据：
《道路交通安全法》第90条规定，对不同违法行为可分别处罚；《北京市关于对部分载客汽车采取交通管理措施的通告》明确，未办理进京证进入六环内属于独立违法行为。

2. 若两次处罚基于同一违法行为，则不合理

若您仅因“未办理进京证进入六环内”被处罚后，在同一天内未离开六环区域，也未实施其他违法行为，但被再次以“未办理进京证”为由处罚，则可能涉及“一事二罚”，属于不合理处罚。

法律依据：
《行政处罚法》第29条规定，对当事人的同一个违法行为，不得给予两次以上罚款的行政处罚。若执法部门无法证明两次处罚针对不同违法行为，您有权通过行政复议或诉讼主张权利。

3. 特殊情形：连续或长时间滞留可能被重复处罚

若您在六环内滞留时间较长（如超过24小时），且未补办进京证，部分执法部门可能以“持续违法状态”为由再次处罚。但此类处罚需满足以下条件：

• 执法部门需明确告知您“持续违法”的处罚规则；
• 两次处罚之间需有合理时间间隔（如跨日）。

建议：
若认为处罚不合理，可要求执法部门出具书面处罚决定书，核对违法行为描述及法律依据。如存在争议，可向北京市交通委员会或属地政府申请行政复议，或直接向法院提起行政诉讼。

总结：
一天内被罚两次是否合理，关键在于两次处罚是否针对不同违法行为。若涉及“未办进京证”单一违法行为，则不合理；若涉及其他独立违法行为，则合理。如有疑问，可提供具体处罚文书内容，我将进一步为您分析。