关于外地车办理进京证后进入二环的处罚问题，以下是根据相关规定给出的详细解答：

首先，需要明确的是，二环路主路（全线）是禁止外省、区、市核发号牌（含临时号牌）的载客汽车通行的。这一限行规定是全天24小时有效的。如果驾驶外地载客汽车进入了二环主路，那么将构成违反限行规定的行为。

对于已办理进京通行证件的外省、区、市载客汽车，如果违反了限行规定，具体处罚如下：

1. 工作日7时至9时、17时至20时在五环路（含）以内道路行驶：这种行为被认定为“机动车违反禁令标志指示”的违法行为，将处100元罚款处罚，并记3分。

2. 在平峰期间违反尾号限行规定：同样被认定为“违反限制通行规定”的违法行为，也将处100元罚款处罚。但需要注意的是，这种情况不记分。

另外，如果未办理进京通行证件的外省、区、市机动车进入六环路（不含）以内道路行驶，同样被认定为“机动车违反禁令标志指示”的违法行为，也将处100元罚款处罚，并记3分。

综上所述，外地车即使办理了进京证，也需要严格遵守北京的限行规定。如果驾驶外地载客汽车进入了二环主路或违反了其他限行规定，将面临相应的罚款和记分处罚。因此，建议外地车主在进京前仔细了解并遵守相关限行规定，以避免不必要的处罚。