违规办理建设工程规划验收合格证，主要违反了《中华人民共和国城乡规划法》的相关规定。具体分析如下：

1. 法律条款依据：

   • 根据《中华人民共和国城乡规划法》第四十五条：“县级以上地方人民政府城乡规划主管部门按照国务院规定对建设工程是否符合规划条件予以核实。未经核实或者经核实不符合规划条件的，建设单位不得组织竣工验收。建设单位应当在竣工验收后六个月内向城乡规划主管部门报送有关竣工验收资料。”
   • 若违规办理建设工程规划验收合格证，即可能涉及未经核实或核实不符合规划条件而擅自办理，这直接违反了上述法律条款的规定。

2. 法律后果：

   • 违规办理可能导致该合格证无效，建设单位可能面临行政处罚，包括但不限于罚款、责令改正、甚至可能影响后续的建设工程使用或销售等。
   • 若因违规办理导致他人权益受损，建设单位还可能承担民事赔偿责任。

3. 实际操作中的注意事项：

   • 建设单位在办理建设工程规划验收合格证时，应确保建设工程已按照规划条件进行建设，并准备好相关的竣工验收资料。
   • 在提交申请前，应自行或委托专业机构对建设工程是否符合规划条件进行核实，以避免违规办理的风险。

4. 建议措施：

   • 若已发现违规办理的情况，建设单位应立即停止使用该合格证，并主动向城乡规划主管部门报告，配合调查并接受处理。
   • 在未来的建设工程中，应加强内部管理，确保所有建设活动都符合城乡规划的要求，避免类似违规行为的发生。

总结来说，违规办理建设工程规划验收合格证是违反《中华人民共和国城乡规划法》的行为，可能带来严重的法律后果。因此，建设单位在办理相关手续时，应严格遵守法律法规，确保建设工程的合法性和合规性。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。