股票合作协议在符合一定条件下是可以起诉的。以下从不同角度为你详细分析：

协议有效性角度

1. 有效协议：如果股票合作协议是双方真实意思表示，内容不违反法律、行政法规的强制性规定，也不违背公序良俗，那么该协议是有效的。当一方违反协议约定，给另一方造成损失时，受损方可以依据协议向法院提起诉讼，要求违约方承担违约责任，比如赔偿损失、继续履行协议等。例如，甲乙双方签订股票合作协议，约定甲出资，乙负责操作股票交易，盈利按一定比例分配。若乙未按照协议约定进行操作，导致甲遭受损失，甲就可以起诉乙要求赔偿。
2. 无效协议：若股票合作协议存在违反法律、行政法规强制性规定等无效情形，如协议中约定通过内幕交易、操纵市场等非法手段获取利益，那么该协议自始无效。在这种情况下，因协议取得的财产，应当予以返还；不能返还或者没有必要返还的，应当折价补偿。有过错的一方应当赔偿对方因此所受到的损失，双方都有过错的，应当各自承担相应的责任。比如，双方在协议中约定利用未公开信息进行股票交易，这种协议无效，若一方因此遭受损失，也可以向有过错的另一方主张赔偿，但赔偿范围会受到协议无效的影响。

纠纷类型角度

1. 合同纠纷：股票合作协议本质上是一种合同，当双方在协议的履行过程中产生争议，如对盈利分配、亏损承担、操作权限等方面存在分歧，且无法通过协商解决时，就可以以合同纠纷为由向法院提起诉讼。法院会根据协议的约定以及相关法律规定，对双方的争议进行审理和判决。
2. 侵权纠纷：如果一方在合作过程中存在侵犯另一方合法权益的行为，如擅自挪用合作资金、泄露商业秘密等，受损方可以以侵权纠纷为由起诉侵权方，要求其承担侵权责任，包括停止侵害、消除影响、赔偿损失等。

诉讼主体角度

1. 协议双方：股票合作协议的签订双方是最直接的诉讼主体。当一方认为另一方违反协议或侵犯其权益时，可以直接以对方为被告向法院提起诉讼。
2. 涉及第三方时的主体确定：在某些情况下，股票合作协议可能会涉及第三方，如证券公司、托管银行等。如果第三方的行为导致协议一方遭受损失，且该损失与协议的履行有关，那么受损方也可以将第三方列为共同被告或第三人，要求其承担相应的责任。但这种情况需要根据具体的案件事实和法律规定来确定。

诉讼时效角度

根据《中华人民共和国民法典》的规定，向人民法院请求保护民事权利的诉讼时效期间为三年。法律另有规定的，依照其规定。在股票合作协议纠纷中，当事人应当在知道或者应当知道权利受到损害以及义务人之日起三年内提起诉讼，否则可能会丧失胜诉权。当然，如果存在诉讼时效中断、中止等法定情形，诉讼时效期间会重新计算或暂停计算。

如果你遇到股票合作协议相关的纠纷，建议先收集好协议文本、交易记录、沟通记录等相关证据，以便在诉讼中更好地维护自己的合法权益。有问题可以直接向我咨询。