结论：租赁合同中约定违约金按千分之三每日计算，可能存在违规风险，具体取决于实际损失情况及法院或仲裁机构的调整。以下从不同角度详细分析：

1. 违约金调整的法律依据

根据《中华人民共和国民法典》第五百八十五条：

• 当事人可以约定一方违约时应当根据违约情况向对方支付一定数额的违约金，也可以约定因违约产生的损失赔偿额的计算方法。
• 约定的违约金低于造成的损失的，人民法院或者仲裁机构可以根据当事人的请求予以增加；约定的违约金过分高于造成的损失的，人民法院或者仲裁机构可以根据当事人的请求予以适当减少。

关键点：违约金是否“过分高于”损失，需由法院或仲裁机构结合实际损失、合同履行情况、当事人过错程度等因素综合判断。

2. 千分之三每日违约金的合理性分析

• 计算方式：千分之三每日即年利率约109.5%（0.3%×365天），远超民间借贷利率司法保护上限（当前为LPR的4倍，约15.4%/年）。
• 司法实践：法院通常以实际损失为基础，参考合同履行情况、当事人过错程度等因素，对过高违约金进行调整。例如：
  • 若租金为每月1万元，按千分之三每日计算，逾期一天违约金为30元，一个月达900元（年化108%），明显超出租金损失的合理范围。
  • 法院可能根据《民法典》第五百八十五条，将违约金调整至实际损失的30%以内（如租金损失的30%）。

3. 行动建议

• 对出租方：
  1. 合理约定违约金：建议根据租金水平、市场惯例及实际损失（如空置期租金、重新出租成本等）设定违约金，避免过高约定被法院调整。
  2. 保留损失证据：若发生违约，需保留租金损失、维修费用等证据，以支持违约金主张。
• 对承租方：
  1. 审查合同条款：若认为违约金过高，可在诉讼或仲裁中请求法院调整。
  2. 及时沟通协商：逾期时主动与出租方协商，争取减免违约金或延长支付期限。

4. 风险提示

• 若违约金约定过高且未被调整，承租方可能面临巨额赔偿；若约定过低，出租方可能无法充分弥补损失。
• 法院调整违约金时，会综合考虑合同履行情况（如承租方已支付部分租金）、双方过错程度（如出租方是否及时催告）等因素。

总结：租赁合同中违约金按千分之三每日计算，存在被法院调整的风险。建议双方根据实际损失合理约定违约金，并在纠纷发生时保留证据、积极协商。如有具体案件或进一步疑问，可直接向我咨询。