关于药店申请中止协议后，超过多少日未申请恢复协议将自动终止的问题，这主要取决于双方签订的租赁合同中的具体约定。以下是从不同角度对此问题的详细分析：

1. 合同约定优先：

   • 在租赁合同中，双方通常会就协议的中止、恢复及终止等条款进行明确约定。如果合同中明确规定了药店申请中止协议后，超过一定期限（如30日、60日等）未申请恢复，则协议将自动终止，那么这一约定将具有法律约束力。
   • 示例：假设合同中约定“药店申请中止协议后，若超过60日未向出租方提出恢复协议的申请，则本协议自动终止”，那么在此情况下，药店若超过60日未申请恢复，协议将自动终止。

2. 合同无约定或约定不明：

   • 如果租赁合同中未就中止协议后的恢复期限及自动终止条款进行明确约定，或者约定不明，那么双方可能需要通过协商、调解或诉讼等方式来解决争议。
   • 在此情况下，法院或仲裁机构可能会根据相关法律法规、行业惯例以及公平原则等因素来综合判断协议是否应继续履行或终止。

3. 法律后果：

   • 若协议因药店超过约定期限未申请恢复而自动终止，药店可能需要承担违约责任，如支付违约金、赔偿损失等。
   • 同时，出租方也有权根据合同约定或法律规定，要求药店返还租赁物、结清相关费用等。

4. 建议：

   • 对于药店而言，在申请中止协议前，应仔细阅读租赁合同中的相关条款，了解中止、恢复及终止的具体规定。
   • 若合同中有明确约定，药店应严格遵守约定，及时在约定期限内申请恢复协议，以避免不必要的法律纠纷。
   • 若合同中无约定或约定不明，药店应与出租方进行积极沟通，寻求双方都能接受的解决方案。

总结来说，药店申请中止协议后超过多少日未申请恢复协议将自动终止，主要取决于租赁合同中的具体约定。若合同中有明确约定，则按约定执行；若合同无约定或约定不明，则可能需要通过协商、调解或诉讼等方式来解决争议。因此，在签订租赁合同时，双方应尽可能明确相关条款，以避免后续的法律纠纷。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。