关于连锁药店合作协议失效时间和规则，核心结论如下：

1. 失效时间：

   • 协议约定终止：若合作协议中明确规定了合作期限，则协议自期限届满之日起失效。例如，协议约定合作期限为五年，自XXXX年XX月XX日起至XXXX年XX月XX日止，那么协议将在XXXX年XX月XX日失效。
   • 提前终止情形：若协议中约定了提前终止的条件，如一方严重违约、不可抗力导致协议无法继续履行等，当这些条件成就时，协议可提前终止。此时，协议失效时间即为提前终止条件成就之日。
   • 法定终止情形：根据《民法典》等相关法律法规，若合作协议存在违法、违背公序良俗等情形，可能被法院或仲裁机构宣告无效或撤销，此时协议自始无效或自撤销之日起失效。

2. 失效规则：

   • 通知义务：在协议即将失效或已决定提前终止时，各方应按照协议约定或法律规定，履行通知义务，告知其他方协议失效或终止的事宜。这有助于减少因信息不对称而产生的纠纷。
   • 结算与清理：协议失效后，各方应按照协议约定进行结算，包括但不限于货款、服务费、违约金等费用的支付与收取。同时，应对合作期间产生的债权债务进行清理，确保各方权益得到保障。
   • 保密与竞业限制：若协议中包含保密条款或竞业限制条款，即使协议失效，各方仍应遵守这些条款的规定。保密条款要求各方对合作期间知悉的商业秘密、技术秘密等予以保密；竞业限制条款则可能限制各方在协议失效后一定期限内从事与协议相关的竞争业务。
   • 争议解决：若协议失效后产生争议，各方应首先通过友好协商解决；协商不成的，可按照协议约定的争议解决方式（如仲裁、诉讼）进行处理。在处理争议时，应依据相关法律法规和协议约定，确保争议得到公正、合理的解决。

法律建议：

• 在签订连锁药店合作协议时，应明确约定合作期限、提前终止条件、失效后的处理规则等关键条款，以减少未来可能产生的纠纷。
• 各方应严格遵守协议约定和法律法规的规定，在协议失效后履行相应的通知、结算、清理等义务。
• 若遇到协议失效后的争议问题，建议及时咨询专业律师，以便得到专业、准确的法律建议。

可能法律后果：

• 若各方未按照协议约定或法律规定履行失效后的处理规则，可能面临违约责任、赔偿责任等法律后果。
• 若因协议失效后的争议处理不当而导致纠纷升级，可能影响各方的商业信誉和合作关系。

如有任何关于连锁药店合作协议失效时间和规则的具体问题或需要进一步的法律建议，请直接向我咨询。