结论前置：土地承包合同内容违法或存在重大误解，不能直接通过村民自治的方式解除违法内容，而应通过法定程序来处理。
详细分析：
合同内容违法的处理：
- 法律依据：根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，违反法律、行政法规的强制性规定的民事法律行为无效。因此，如果土地承包合同的内容违反了法律或行政法规的强制性规定，该合同或合同中的违法条款是无效的。
- 处理方式：合同内容违法时，不能通过村民自治的方式（如村民会议或村民代表会议决议）来解除或修改违法内容。正确的做法是，由合同的一方或双方，或者利害关系人向人民法院或仲裁机构申请确认合同无效或撤销违法条款。在确认无效或撤销后，合同双方应根据实际情况协商解决后续事宜，如重新签订合法合同或恢复原状等。
合同存在重大误解的处理：
- 法律依据：同样根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，基于重大误解实施的民事法律行为，行为人有权请求人民法院或者仲裁机构予以撤销。
- 处理方式：如果土地承包合同存在重大误解，合同的一方或双方可以向人民法院或仲裁机构申请撤销合同或误解部分的条款。这同样不能通过村民自治的方式来实现。撤销后，合同双方也应根据实际情况协商解决后续事宜。
村民自治的适用范围：
- 村民自治主要适用于村内的公共事务和公益事业的管理，如制定村规民约、决定村内公共设施的建设等。它并不适用于处理具体的民事合同纠纷，尤其是涉及合同效力的问题。
法律建议：
- 如果您发现土地承包合同内容违法或存在重大误解，建议首先收集相关证据，如合同文本、相关法律法规、误解产生的证据等。
- 然后，您可以咨询专业律师（即我，李文杰律师，专注于遗产继承、债权债务、刑事辩护、租赁合同领域），了解具体的法律程序和可能的法律后果。
- 最后，根据律师的建议，向人民法院或仲裁机构申请确认合同无效、撤销违法或误解部分的条款，并协商解决后续事宜。
可能法律后果：
- 如果合同内容被确认违法或存在重大误解并被撤销，合同双方可能需要承担因合同无效或撤销而产生的法律责任，如返还财产、赔偿损失等。
- 如果合同双方无法就后续事宜达成一致，可能需要通过诉讼或仲裁来解决争议。
希望以上分析能对您有所帮助。如果您有任何进一步的法律问题或需要进一步的法律建议，请随时向我咨询。