结论：卖淫行为过了两年，老板被抓后是否还会处理，这主要取决于老板被抓时是否仍在从事相关违法活动，以及之前卖淫行为是否已被公安机关掌握并立案侦查。具体来说，有以下几种情况：
若老板被抓时仍在从事组织卖淫等违法活动：
- 根据《中华人民共和国刑法》第三百五十八条的规定，组织、强迫他人卖淫的，处五年以上十年以下有期徒刑，并处罚金；情节严重的，处十年以上有期徒刑或者无期徒刑，并处罚金或者没收财产。
- 在这种情况下，即使卖淫行为已经过去两年，但老板被抓时仍在继续违法，那么公安机关会依法对其进行处理，包括之前的卖淫行为（如果之前未处理且仍在追诉期内）和当前的违法活动。
若老板被抓时已停止从事组织卖淫等违法活动，但之前卖淫行为已被公安机关掌握并立案侦查：
- 如果公安机关在老板被抓前已经掌握了其组织卖淫的证据，并已经立案侦查，那么即使卖淫行为已经过去两年，老板仍然会受到法律的制裁。
- 追诉期限是刑事诉讼中的一个重要概念，它指的是对犯罪分子追究刑事责任的有效期限。根据《中华人民共和国刑法》第八十七条的规定，法定最高刑为不满五年有期徒刑的，经过五年不再追诉；法定最高刑为五年以上不满十年有期徒刑的，经过十年不再追诉；以此类推。组织卖淫罪的法定刑较重，因此其追诉期限也相对较长。
若老板被抓时已停止从事组织卖淫等违法活动，且之前卖淫行为未被公安机关掌握或已过追诉期限：
- 如果老板在卖淫行为发生后已经停止了相关违法活动，并且公安机关在老板被抓前并未掌握其组织卖淫的证据，或者该行为已经超过了追诉期限，那么老板可能不会因之前的卖淫行为而受到法律制裁。
- 但需要注意的是，如果老板在卖淫行为期间还涉及其他违法犯罪活动（如诈骗、敲诈勒索等），且这些活动未被公安机关掌握或未过追诉期限，那么老板仍然可能因这些活动而受到法律制裁。
法律建议：
- 对于涉及卖淫等违法活动的个人或组织，应尽早停止相关活动，并主动向公安机关投案自首，以争取从轻或减轻处罚。
- 如果已经因卖淫等违法活动被公安机关立案侦查或采取强制措施，应积极配合公安机关的调查工作，如实陈述事实，提供相关证据，以便公安机关查明事实真相，依法作出处理。
- 在任何情况下，都应遵守法律法规，不参与任何违法犯罪活动，以维护社会的和谐稳定和个人的合法权益。
可能法律后果：
- 如果老板被抓时仍在从事组织卖淫等违法活动，或者之前卖淫行为已被公安机关掌握并立案侦查且未过追诉期限，那么老板将面临法律的制裁，包括有期徒刑、罚金等。
- 如果老板在卖淫行为期间还涉及其他违法犯罪活动，且这些活动未被公安机关掌握或未过追诉期限，那么老板还可能因这些活动而面临更严重的法律后果。
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