关于事业单位离职时公务卡是否需要注销的问题，这主要取决于单位的具体管理规定以及公务卡的使用协议。不过，我可以根据一般的管理实践和相关规定，给您一个较为全面的解答。

首先，从公务卡的管理原则来看，公务卡通常是实行“一人一卡”实名管理的。这意味着每张公务卡都与特定的持卡人相对应，用于该持卡人的公务支出。当持卡人发生变动，比如调离原单位时，单位通常会要求持卡人办理相关变更或注销手续，以确保公务卡的使用和管理符合规范。

其次，从单位财务管理的角度考虑，及时注销离职员工的公务卡有助于单位更好地管理财务资源，避免不必要的风险和费用。例如，如果离职员工的公务卡未及时注销，可能会存在被他人冒用或产生不必要的透支费用等风险。这些风险不仅可能给单位带来经济损失，还可能影响单位的财务管理和声誉。

再者，根据一些地方或单位的具体管理规定，如海西州财政部门下发的《关于加强规范使用公务卡管理的通知》中就明确提到，对持卡人因离职、退休、调动离开单位的，应及时在数字财政系统公务卡模块停用。这里的“停用”可以理解为包括注销或暂停使用等措施，以确保公务卡不再被离职员工使用。

综合以上分析，虽然具体是否需要注销公务卡可能因单位而异，但一般来说，为了保障单位财务管理的规范性和安全性，以及避免不必要的风险和费用，事业单位在员工离职时通常会要求或建议员工注销公务卡。当然，如果单位有特别的规定或者公务卡使用协议中有其他约定，那么应按照这些规定或约定来执行。

最后，我建议您在离职前与所在单位的财务部门或相关管理部门进行沟通，了解具体的公务卡注销流程和要求，以确保您能够顺利、合规地完成离职手续。