结论前置：出差不满出差时间扣三天工资是否合法，需根据具体情况判断，一般情况下，若公司规章制度或劳动合同无明确规定，且扣除工资无合理理由，则不合法。以下从不同角度详细分析：
一、公司规章制度与劳动合同的约定
有明确规定且合法合理：
- 如果公司的规章制度或劳动合同中明确规定了出差未满时间扣除工资的条款，并且该条款的制定程序合法（如经过职工代表大会或全体职工讨论，与工会或职工代表平等协商确定），内容合理（如扣除的工资数额与未完成出差任务的损失相当），则该条款对员工具有约束力，公司扣除工资可能合法。
无明确规定或规定不合法：
- 如果公司的规章制度或劳动合同中没有明确规定出差未满时间扣除工资的条款，或者该条款的制定程序不合法、内容不合理，则公司无权扣除员工工资。此时，公司扣除工资的行为可能构成违法。
二、扣除工资的合理性
有合理理由：
- 即使公司规章制度或劳动合同中有扣除工资的条款，但如果公司能够证明员工未完成出差任务给公司造成了实际损失，并且扣除的工资数额与损失相当，则扣除工资可能具有合理性。然而，这种情况下，公司需要承担举证责任，证明损失的存在以及扣除工资的合理性。
无合理理由：
- 如果公司无法证明员工未完成出差任务给公司造成了实际损失，或者扣除的工资数额明显高于损失，则扣除工资可能不具有合理性。此时，公司扣除工资的行为可能构成违法，员工有权要求公司补发工资。
三、法律依据
- 根据《中华人民共和国劳动法》第五十条：“工资应当以货币形式按月支付给劳动者本人。不得克扣或者无故拖欠劳动者的工资。”
- 根据《中华人民共和国劳动合同法》第三十条：“用人单位应当按照劳动合同约定和国家规定，向劳动者及时足额支付劳动报酬。用人单位拖欠或者未足额支付劳动报酬的，劳动者可以依法向当地人民法院申请支付令，人民法院应当依法发出支付令。”
四、建议与行动
与公司沟通：
- 如果员工认为公司扣除工资的行为不合法或不合理，首先可以尝试与公司沟通，了解扣除工资的具体原因和依据，并要求公司补发工资。
申请劳动仲裁：
- 如果沟通无果，员工可以向当地劳动仲裁委员会申请劳动仲裁，要求公司补发工资并承担相应的法律责任。在申请劳动仲裁时，员工需要提供相关证据证明公司扣除工资的行为不合法或不合理。
寻求法律援助：
- 如果员工在劳动仲裁过程中遇到困难或需要法律帮助，可以寻求专业律师的法律援助。律师可以提供法律咨询、代理仲裁或诉讼等服务，帮助员工维护自己的合法权益。
总结：出差不满出差时间扣三天工资是否合法，需根据公司的规章制度、劳动合同的约定以及扣除工资的合理性来判断。如果公司无法提供合法合理的依据，员工有权要求公司补发工资并承担相应的法律责任。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。