结论：公交客运没有道路运输证的情况下签订的包车合同，一般不受法律保护，可能面临合同无效、行政处罚等法律后果。但具体还需结合实际情况判断。以下从不同角度详细分析：
一、合同效力角度
合同无效情形：
- 根据《中华人民共和国民法典》及相关法律法规，违反法律、行政法规的强制性规定的合同无效。道路运输证是从事道路运输经营活动的法定凭证，未取得道路运输证而从事包车客运业务，属于违法经营。因此，若公交客运公司未取得道路运输证，其签订的包车合同可能因违反法律强制性规定而被认定为无效。
合同效力相对性：
- 合同无效仅指合同本身不具有法律效力，但并不意味着合同双方完全不受约束。例如，因合同无效而取得的财产应当予以返还；有过错的一方应当赔偿对方因此所受到的损失。
二、行政处罚角度
违法经营处罚：
- 根据《中华人民共和国道路运输条例》等相关规定，未取得道路运输证而从事道路运输经营活动的，由县级以上地方人民政府交通运输主管部门责令停止经营，并处以罚款。因此，公交客运公司未取得道路运输证而签订包车合同并从事包车客运业务，可能面临行政处罚。
处罚对象：
- 行政处罚的对象通常是违法经营的主体，即公交客运公司。但若合同相对方（如包车方）明知或应知公交客运公司未取得道路运输证而仍与其签订合同，也可能承担一定的法律责任，如共同违法或协助违法等。
三、实际履行角度
合同履行障碍：
- 若公交客运公司未取得道路运输证，其可能无法正常履行包车合同中的运输义务。例如，可能因违法经营而被交通运输主管部门查处，导致运输服务中断或无法提供。
风险承担：
- 在合同履行过程中，若因公交客运公司未取得道路运输证而导致合同无法履行或产生其他损失，风险通常由公交客运公司承担。但若合同相对方（如包车方）存在过错（如明知或应知公交客运公司未取得道路运输证而仍与其签订合同），则可能需承担相应的风险。
四、建议与风险提示
合法经营：
- 公交客运公司应依法取得道路运输证等必要证件，确保合法经营。在签订包车合同前，应仔细审查自身资质和合同条款，确保合同合法有效。
合同审查：
- 合同相对方（如包车方）在签订包车合同前，应仔细审查公交客运公司的资质和证件情况，确保其具备从事包车客运业务的合法资格。若发现公交客运公司未取得道路运输证等必要证件，应谨慎签订合同或要求其提供合法证明。
法律咨询：
- 在签订包车合同或涉及其他法律问题时，建议咨询专业律师以获取准确的法律意见和风险提示。
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