结论：持证经营者销售违法卷烟价值总额达5万元，是否移送公安机关立案调查，需结合具体违法情节及法律规定综合判断，但通常情况下，该金额已达到刑事立案标准，存在被移送公安机关立案调查的可能性。

分析如下：

1. 违法行为的性质：

   • 销售违法卷烟，首先违反了烟草专卖法律法规，可能构成行政违法。若情节严重，如销售金额较大、销售数量较多或存在其他恶劣情节，则可能进一步构成刑事犯罪，即非法经营罪或销售伪劣产品罪等。

2. 刑事立案标准：

   • 根据《中华人民共和国刑法》及相关司法解释，非法经营烟草专卖品，情节严重的，可构成非法经营罪。其中，“情节严重”通常包括销售金额达到一定数额。虽然具体数额标准可能因地区和具体案情而异，但5万元的销售金额在多数情况下已达到或超过刑事立案的起点。
   • 同时，如果销售的卷烟是伪劣产品，且销售金额达到5万元以上，还可能构成销售伪劣产品罪。

3. 移送公安机关的条件：

   • 当行政执法机关（如烟草专卖局）在查处过程中发现违法行为可能构成犯罪时，应当依法将案件移送公安机关立案侦查。这通常发生在违法行为情节严重、社会危害性较大，且行政处罚已不足以惩处的情况下。
   • 对于持证经营者销售违法卷烟价值总额达5万元的情况，如果行政执法机关认为该行为已构成犯罪，或者存在其他需要公安机关介入调查的情形（如涉及跨地区销售、团伙作案等），则应当将案件移送公安机关。

4. 后续法律程序：

   • 一旦案件被移送公安机关，公安机关将依法进行立案侦查，收集证据，查明事实。如果证据充分，公安机关将提请检察院审查起诉。
   • 检察院审查后，如果认为构成犯罪，将向法院提起公诉。法院将依法审理案件，并作出判决。

建议：

• 对于持证经营者而言，应严格遵守烟草专卖法律法规，不得销售违法卷烟。如果发现自身行为可能涉嫌违法或犯罪，应立即停止销售，并主动向烟草专卖局或公安机关说明情况，配合调查。
• 如果已经面临行政执法机关的查处或公安机关的立案侦查，应积极配合调查，如实陈述事实，提供相关证据。同时，可以寻求专业律师的帮助，以维护自身合法权益。

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