结论：卷烟持证户不在原地经营卷烟达到5万元以上，并不直接构成非法经营罪，但可能涉及其他行政处罚或刑事责任，具体需结合实际情况判断。以下从多个角度进行分析：

一、非法经营罪的构成要件

非法经营罪是指违反国家规定，未经许可经营专营、专卖物品或其他限制买卖的物品，扰乱市场秩序，情节严重的行为。其构成要件主要包括：

1. 主体要件：一般主体，即达到刑事责任年龄、具有刑事责任能力的自然人或单位。
2. 主观要件：故意，即明知自己的行为违反国家规定，仍希望或放任这种结果发生。
3. 客体要件：市场秩序，即国家对专营、专卖物品或其他限制买卖物品的管理秩序。
4. 客观要件：未经许可经营专营、专卖物品或其他限制买卖的物品，扰乱市场秩序，情节严重。

二、卷烟持证户不在原地经营卷烟的法律分析

1. 持证经营：卷烟持证户已经获得了经营卷烟的许可，这是其合法经营的基础。然而，许可通常会有一定的地域限制，即持证户只能在指定的地点经营卷烟。

2. 不在原地经营：如果持证户不在原地经营卷烟，而是将卷烟销售到其他地点，这可能违反了许可的地域限制。但这种行为本身并不直接等同于非法经营，因为它没有改变持证户已经获得经营许可的事实。

3. 达到5万元以上：销售额达到5万元以上，是判断行为是否“情节严重”的一个参考因素。然而，仅凭销售额并不能直接确定是否构成非法经营罪，还需要考虑其他因素，如是否扰乱了市场秩序、是否造成了严重后果等。

三、可能涉及的法律后果

1. 行政处罚：如果持证户不在原地经营卷烟，但并未扰乱市场秩序或造成严重后果，可能面临的是行政处罚，如罚款、吊销许可证等。

2. 刑事责任：如果持证户的行为不仅违反了许可的地域限制，还扰乱了市场秩序，且情节严重（如销售额巨大、造成恶劣影响等），则可能构成非法经营罪，需要承担刑事责任。但这种情况需要具体证据支持，不能仅凭销售额就断定。

四、建议与注意事项

1. 遵守许可规定：持证户应严格遵守许可的地域限制和其他相关规定，避免不必要的法律风险。

2. 及时咨询：如果持证户有不在原地经营卷烟的需求或计划，建议及时咨询当地烟草专卖部门或法律专业人士，了解相关法律法规和政策要求。

3. 保留证据：如果持证户因不在原地经营卷烟而面临法律纠纷或处罚，应保留好相关证据（如销售记录、合同、许可证等），以便在需要时进行维权或申诉。

总结来说，卷烟持证户不在原地经营卷烟达到5万元以上，并不直接构成非法经营罪。但持证户应严格遵守许可规定，避免不必要的法律风险。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。