针对您提出的“烟草专卖查获案值五万元以上的真烟应如何处理”的问题，以下是我为您提供的详细解答：
首先，需要明确的是，查获案值五万元以上的真烟，并不直接等同于销售非法生产的烟草专卖品的行为，但这一案值金额已经达到了一个需要特别关注的阈值。在烟草专卖管理中，对于查获的真烟，其处理方式主要取决于这些烟草的来源、销售情况以及是否涉及违法违规行为。
一、若查获的真烟来源合法，但存在违规销售行为
调查核实：烟草专卖部门会首先对查获的真烟进行详细的调查核实，包括其来源、销售渠道、销售记录等，以确定是否存在违规销售行为，如未取得烟草专卖零售许可证进行销售、超范围销售等。
行政处罚：如果确认存在违规销售行为，烟草专卖部门将依据相关法律法规，对违规者进行行政处罚，包括罚款、没收违法所得、吊销烟草专卖零售许可证等。对于案值五万元以上的情况，处罚力度可能会相对较大。
真烟处理：对于查获的真烟，如果其来源合法且未涉及其他违法犯罪行为，烟草专卖部门可能会将其依法拍卖或进行其他合法处理，以避免资源浪费。
二、若查获的真烟涉及非法生产或销售非法生产的烟草专卖品
立案追诉：如果查获的真烟实际上是非法的（如假冒伪劣产品），或者其销售行为构成了销售非法生产的烟草专卖品，且案值达到五万元以上，那么这将构成严重的经济犯罪行为。烟草专卖部门将联合公安机关进行立案追诉。
刑事处罚：根据《最高人民检察院、公安部关于公安机关管辖的刑事案件立案追诉标准的规定（二）》等相关法律法规，销售非法生产的烟草专卖品，若销售金额、货值金额或两者合计达到一定标准（如五万元以上），将依法追究刑事责任，包括有期徒刑、罚金等。
真烟及违法所得处理：对于查获的非法真烟及违法所得，将依法进行没收，并可能进行销毁处理，以防止其再次流入市场。
三、地区差异与执行
需要注意的是，不同地区的烟草专卖管理部门在执行相关法律法规时可能会有所差异。因此，在实际操作中，应结合当地的相关规定和实践来判断。如果您对当地的具体执行情况有疑问，建议咨询当地的烟草专卖管理部门或法律专业人士。
综上所述，对于查获案值五万元以上的真烟，其处理方式主要取决于这些烟草的来源、销售情况以及是否涉及违法违规行为。如果来源合法但存在违规销售行为，将进行行政处罚；如果涉及非法生产或销售非法生产的烟草专卖品，则将依法进行立案追诉和刑事处罚。