在双方有争议的耕地上，一方使用收割机进行收割的行为，可能构成侵权行为，具体取决于该行为是否侵犯了另一方的合法权益。以下是对此问题的详细分析：
一、行为性质分析
土地使用权争议：
- 如果双方对耕地的使用权存在争议，且尚未通过法律途径解决，那么任何一方擅自使用收割机进行收割，都可能被视为对另一方土地使用权的侵犯。
财产权保护：
- 耕地上的作物属于财产范畴，受到法律保护。如果一方未经另一方同意，擅自收割其作物，可能构成对另一方财产权的侵犯。
二、法律后果
民事责任：
- 根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，侵犯他人财产权的，应当承担民事责任，包括停止侵害、赔偿损失等。因此，如果一方擅自收割另一方的作物，另一方有权要求其停止侵害，并赔偿因此造成的损失。
行政责任：
- 如果该行为情节严重，如涉及多次侵权、造成较大损失等，还可能构成违反治安管理行为，根据《中华人民共和国治安管理处罚法》的相关规定，可能面临行政处罚，如拘留、罚款等。
刑事责任（极端情况）：
- 在极端情况下，如果该行为构成犯罪，如故意毁坏财物罪等，还可能面临刑事责任。但这种情况较为罕见，通常需要满足特定的构成要件。
三、建议措施
协商解决：
- 在发生争议时，双方应首先尝试通过协商解决。可以邀请第三方（如村委会、调解委员会等）进行调解，以达成和解协议。
法律途径：
- 如果协商无果，双方可以通过法律途径解决争议。可以向人民法院提起诉讼，要求确认土地使用权归属、赔偿损失等。
保留证据：
- 在争议发生过程中，双方应保留好相关证据，如土地权属证明、作物种植记录、收割现场照片或视频等。这些证据在后续的法律程序中可能起到关键作用。
四、具体案例参考
- 假设双方对一块耕地的使用权存在争议，且该耕地上种植了作物。在作物成熟后，一方未经另一方同意，擅自使用收割机进行收割。此时，另一方可以收集相关证据（如土地权属证明、作物种植记录、收割现场照片等），并向人民法院提起诉讼，要求确认土地使用权归属并赔偿损失。
综上所述，一方在双方有争议的耕地上使用收割机进行收割的行为，可能构成侵权行为。双方应首先尝试通过协商解决争议，如果协商无果，则可以通过法律途径解决。在争议发生过程中，双方应保留好相关证据以备后续使用。如果你有进一步的法律问题或需要更具体的法律建议，可以直接向我咨询。