单位收取停薪留职费是否合法，需结合具体情况及法律法规综合判断，但通常情况下，单位不应收取所谓的“停薪留职费”，而是应通过合法协商确定停薪留职的相关事宜。以下是对此问题的详细分析：
合法情形下的停薪留职
协商一致且有明确约定：
- 用人单位与劳动者应就停薪留职事宜进行充分沟通和协商，双方自愿达成一致意见。这一过程中，单位不应要求劳动者支付任何形式的“停薪留职费”，而是应明确约定停薪留职的期限、双方权利义务等内容，确保双方权益得到保障。
- 例如，因经营困难进行业务调整时，单位可与员工协商停薪留职，并在协议中约定保留社保缴纳等事项，但无需员工支付额外费用。
符合内部规章制度：
- 单位内部应有关于停薪留职的合法规章制度，该规章制度的制定程序应合法（如经过民主程序制定、向劳动者公示等）。
- 员工按照规章制度规定的流程申请并获得批准后进行停薪留职，同样无需支付“停薪留职费”。
劳动关系存续：
- 即使员工停薪留职，其与用人单位之间的劳动关系仍然存续，受《劳动法》保护。这意味着，单位无权因停薪留职而向员工收取额外费用。
违法情形下的“停薪留职费”
未经协商擅自决定收取费用：
- 如果用人单位未与劳动者协商，单方强制要求劳动者支付“停薪留职费”，这侵犯了劳动者的合法权益，属于违法行为。
违反法律法规强制性规定：
- 任何要求劳动者支付“停薪留职费”的行为，如果违反了《劳动法》、《社会保险法》等相关法律法规的强制性规定，都是违法的。例如，单位在停薪留职期间停止为员工缴纳社会保险，并以此为由要求员工支付“停薪留职费”以“补偿”社保费用，这是完全不合法的。
损害劳动者权益的不合理安排：
- 如果单位以收取“停薪留职费”为条件，迫使劳动者接受不合理的停薪留职期限或其他条件，这也可能涉嫌违法。
合法解决方案建议
- 若单位面临经营困难或其他需要调整员工工作的情况，应考虑采取其他合法且人性化的解决方案，如调整工作安排、减少工作时间、降低工资等。这些方案需在与员工充分沟通、协商一致的基础上进行，且无需员工支付任何额外费用。
- 确保所有措施均符合法律法规的规定，尊重并保障员工的劳动权益。
维权途径
- 若劳动者认为单位的停薪留职安排或要求支付“停薪留职费”的行为侵犯了自身合法权益，应先与单位进行沟通协商。
- 协商不成的，可向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁来维护自己的权益。
综上所述，单位通常不应收取所谓的“停薪留职费”。如果单位有此类要求，劳动者应谨慎对待，并考虑通过合法途径维护自己的权益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。